Protein–RNA interactions for Protein: O00300

TNFRSF11B, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 11B, humanhuman

Predictions only

Length 401 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF11BO00300 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TNFRSF11BO00300 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TNFRSF11BO00300 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TNFRSF11BO00300 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TNFRSF11BO00300 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TNFRSF11BO00300 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TNFRSF11BO00300 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TNFRSF11BO00300 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TNFRSF11BO00300 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TNFRSF11BO00300 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TNFRSF11BO00300 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TNFRSF11BO00300 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TNFRSF11BO00300 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TNFRSF11BO00300 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
TNFRSF11BO00300 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
TNFRSF11BO00300 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
TNFRSF11BO00300 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TNFRSF11BO00300 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TNFRSF11BO00300 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TNFRSF11BO00300 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TNFRSF11BO00300 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TNFRSF11BO00300 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TNFRSF11BO00300 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TNFRSF11BO00300 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TNFRSF11BO00300 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
TNFRSF11BO00300 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TNFRSF11BO00300 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
TNFRSF11BO00300 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TNFRSF11BO00300 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TNFRSF11BO00300 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TNFRSF11BO00300 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TNFRSF11BO00300 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TNFRSF11BO00300 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TNFRSF11BO00300 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TNFRSF11BO00300 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TNFRSF11BO00300 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TNFRSF11BO00300 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TNFRSF11BO00300 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
TNFRSF11BO00300 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TNFRSF11BO00300 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TNFRSF11BO00300 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TNFRSF11BO00300 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TNFRSF11BO00300 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.19
TNFRSF11BO00300 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TNFRSF11BO00300 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TNFRSF11BO00300 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TNFRSF11BO00300 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TNFRSF11BO00300 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TNFRSF11BO00300 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TNFRSF11BO00300 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TNFRSF11BO00300 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TNFRSF11BO00300 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TNFRSF11BO00300 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
TNFRSF11BO00300 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TNFRSF11BO00300 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TNFRSF11BO00300 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TNFRSF11BO00300 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TNFRSF11BO00300 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TNFRSF11BO00300 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TNFRSF11BO00300 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TNFRSF11BO00300 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TNFRSF11BO00300 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TNFRSF11BO00300 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TNFRSF11BO00300 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TNFRSF11BO00300 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TNFRSF11BO00300 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TNFRSF11BO00300 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TNFRSF11BO00300 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TNFRSF11BO00300 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TNFRSF11BO00300 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TNFRSF11BO00300 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TNFRSF11BO00300 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TNFRSF11BO00300 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
TNFRSF11BO00300 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TNFRSF11BO00300 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TNFRSF11BO00300 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TNFRSF11BO00300 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TNFRSF11BO00300 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TNFRSF11BO00300 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TNFRSF11BO00300 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TNFRSF11BO00300 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TNFRSF11BO00300 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TNFRSF11BO00300 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TNFRSF11BO00300 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TNFRSF11BO00300 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TNFRSF11BO00300 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TNFRSF11BO00300 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TNFRSF11BO00300 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TNFRSF11BO00300 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
TNFRSF11BO00300 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TNFRSF11BO00300 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TNFRSF11BO00300 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TNFRSF11BO00300 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TNFRSF11BO00300 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TNFRSF11BO00300 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TNFRSF11BO00300 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TNFRSF11BO00300 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TNFRSF11BO00300 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TNFRSF11BO00300 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TNFRSF11BO00300 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms