Protein–RNA interactions for Protein: O00253

AGRP, Agouti-related protein, humanhuman

Predictions only

Length 132 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGRPO00253 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
AGRPO00253 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
AGRPO00253 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
AGRPO00253 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
AGRPO00253 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
AGRPO00253 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
AGRPO00253 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
AGRPO00253 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
AGRPO00253 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
AGRPO00253 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
AGRPO00253 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
AGRPO00253 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
AGRPO00253 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
AGRPO00253 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
AGRPO00253 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
AGRPO00253 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
AGRPO00253 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
AGRPO00253 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
AGRPO00253 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
AGRPO00253 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
AGRPO00253 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
AGRPO00253 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
AGRPO00253 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
AGRPO00253 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
AGRPO00253 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
AGRPO00253 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
AGRPO00253 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
AGRPO00253 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
AGRPO00253 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
AGRPO00253 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
AGRPO00253 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
AGRPO00253 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
AGRPO00253 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
AGRPO00253 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
AGRPO00253 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
AGRPO00253 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
AGRPO00253 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
AGRPO00253 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
AGRPO00253 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
AGRPO00253 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
AGRPO00253 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
AGRPO00253 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
AGRPO00253 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
AGRPO00253 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
AGRPO00253 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
AGRPO00253 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
AGRPO00253 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
AGRPO00253 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
AGRPO00253 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
AGRPO00253 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
AGRPO00253 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
AGRPO00253 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
AGRPO00253 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
AGRPO00253 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
AGRPO00253 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
AGRPO00253 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
AGRPO00253 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
AGRPO00253 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
AGRPO00253 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
AGRPO00253 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
AGRPO00253 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
AGRPO00253 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
AGRPO00253 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
AGRPO00253 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
AGRPO00253 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
AGRPO00253 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
AGRPO00253 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
AGRPO00253 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
AGRPO00253 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
AGRPO00253 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
AGRPO00253 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
AGRPO00253 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
AGRPO00253 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
AGRPO00253 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
AGRPO00253 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
AGRPO00253 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
AGRPO00253 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
AGRPO00253 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
AGRPO00253 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
AGRPO00253 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
AGRPO00253 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
AGRPO00253 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
AGRPO00253 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
AGRPO00253 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
AGRPO00253 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
AGRPO00253 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
AGRPO00253 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
AGRPO00253 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
AGRPO00253 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
AGRPO00253 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
AGRPO00253 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
AGRPO00253 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
AGRPO00253 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
AGRPO00253 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
AGRPO00253 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
AGRPO00253 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
AGRPO00253 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
AGRPO00253 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
AGRPO00253 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23.61■■□□□ 1.37
AGRPO00253 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.5 ms