Protein–RNA interactions for Protein: O00124

UBXN8, UBX domain-containing protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN8O00124 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
UBXN8O00124 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
UBXN8O00124 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
UBXN8O00124 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
UBXN8O00124 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
UBXN8O00124 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
UBXN8O00124 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
UBXN8O00124 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
UBXN8O00124 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
UBXN8O00124 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
UBXN8O00124 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
UBXN8O00124 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
UBXN8O00124 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
UBXN8O00124 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
UBXN8O00124 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
UBXN8O00124 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
UBXN8O00124 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
UBXN8O00124 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
UBXN8O00124 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
UBXN8O00124 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
UBXN8O00124 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
UBXN8O00124 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
UBXN8O00124 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
UBXN8O00124 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
UBXN8O00124 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
UBXN8O00124 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
UBXN8O00124 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
UBXN8O00124 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
UBXN8O00124 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
UBXN8O00124 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
UBXN8O00124 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
UBXN8O00124 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
UBXN8O00124 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
UBXN8O00124 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
UBXN8O00124 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
UBXN8O00124 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
UBXN8O00124 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
UBXN8O00124 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
UBXN8O00124 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
UBXN8O00124 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC24.02■■□□□ 1.44
UBXN8O00124 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
UBXN8O00124 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
UBXN8O00124 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
UBXN8O00124 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
UBXN8O00124 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
UBXN8O00124 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
UBXN8O00124 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
UBXN8O00124 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
UBXN8O00124 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
UBXN8O00124 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
UBXN8O00124 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
UBXN8O00124 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
UBXN8O00124 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
UBXN8O00124 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
UBXN8O00124 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
UBXN8O00124 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
UBXN8O00124 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
UBXN8O00124 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
UBXN8O00124 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
UBXN8O00124 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
UBXN8O00124 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
UBXN8O00124 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
UBXN8O00124 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
UBXN8O00124 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
UBXN8O00124 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
UBXN8O00124 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
UBXN8O00124 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
UBXN8O00124 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
UBXN8O00124 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
UBXN8O00124 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
UBXN8O00124 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
UBXN8O00124 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
UBXN8O00124 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
UBXN8O00124 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
UBXN8O00124 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
UBXN8O00124 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
UBXN8O00124 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
UBXN8O00124 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
UBXN8O00124 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
UBXN8O00124 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
UBXN8O00124 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
UBXN8O00124 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
UBXN8O00124 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
UBXN8O00124 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
UBXN8O00124 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
UBXN8O00124 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
UBXN8O00124 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
UBXN8O00124 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
UBXN8O00124 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
UBXN8O00124 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
UBXN8O00124 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
UBXN8O00124 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
UBXN8O00124 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
UBXN8O00124 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
UBXN8O00124 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
UBXN8O00124 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
UBXN8O00124 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
UBXN8O00124 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
UBXN8O00124 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
UBXN8O00124 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.4 ms