Protein–RNA interactions for Protein: H3BU86

STX16-NPEPL1, STX16-NPEPL1 readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 382 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STX16-NPEPL1H3BU86 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
STX16-NPEPL1H3BU86 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
STX16-NPEPL1H3BU86 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
STX16-NPEPL1H3BU86 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
STX16-NPEPL1H3BU86 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
STX16-NPEPL1H3BU86 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
STX16-NPEPL1H3BU86 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
STX16-NPEPL1H3BU86 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
STX16-NPEPL1H3BU86 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
STX16-NPEPL1H3BU86 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
STX16-NPEPL1H3BU86 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
STX16-NPEPL1H3BU86 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
STX16-NPEPL1H3BU86 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
STX16-NPEPL1H3BU86 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
STX16-NPEPL1H3BU86 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
STX16-NPEPL1H3BU86 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
STX16-NPEPL1H3BU86 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
STX16-NPEPL1H3BU86 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
STX16-NPEPL1H3BU86 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
STX16-NPEPL1H3BU86 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
STX16-NPEPL1H3BU86 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
STX16-NPEPL1H3BU86 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
STX16-NPEPL1H3BU86 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
STX16-NPEPL1H3BU86 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
STX16-NPEPL1H3BU86 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24■■□□□ 1.43
STX16-NPEPL1H3BU86 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
STX16-NPEPL1H3BU86 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
STX16-NPEPL1H3BU86 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
STX16-NPEPL1H3BU86 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
STX16-NPEPL1H3BU86 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
STX16-NPEPL1H3BU86 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
STX16-NPEPL1H3BU86 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
STX16-NPEPL1H3BU86 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
STX16-NPEPL1H3BU86 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
STX16-NPEPL1H3BU86 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
STX16-NPEPL1H3BU86 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
STX16-NPEPL1H3BU86 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
STX16-NPEPL1H3BU86 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
STX16-NPEPL1H3BU86 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
STX16-NPEPL1H3BU86 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
STX16-NPEPL1H3BU86 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
STX16-NPEPL1H3BU86 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
STX16-NPEPL1H3BU86 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
STX16-NPEPL1H3BU86 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
STX16-NPEPL1H3BU86 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
STX16-NPEPL1H3BU86 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
STX16-NPEPL1H3BU86 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
STX16-NPEPL1H3BU86 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
STX16-NPEPL1H3BU86 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
STX16-NPEPL1H3BU86 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
STX16-NPEPL1H3BU86 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
STX16-NPEPL1H3BU86 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
STX16-NPEPL1H3BU86 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
STX16-NPEPL1H3BU86 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
STX16-NPEPL1H3BU86 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
STX16-NPEPL1H3BU86 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
STX16-NPEPL1H3BU86 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
STX16-NPEPL1H3BU86 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
STX16-NPEPL1H3BU86 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
STX16-NPEPL1H3BU86 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
STX16-NPEPL1H3BU86 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
STX16-NPEPL1H3BU86 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
STX16-NPEPL1H3BU86 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
STX16-NPEPL1H3BU86 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
STX16-NPEPL1H3BU86 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
STX16-NPEPL1H3BU86 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
STX16-NPEPL1H3BU86 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
STX16-NPEPL1H3BU86 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
STX16-NPEPL1H3BU86 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
STX16-NPEPL1H3BU86 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
STX16-NPEPL1H3BU86 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
STX16-NPEPL1H3BU86 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
STX16-NPEPL1H3BU86 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
STX16-NPEPL1H3BU86 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
STX16-NPEPL1H3BU86 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
STX16-NPEPL1H3BU86 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
STX16-NPEPL1H3BU86 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
STX16-NPEPL1H3BU86 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
STX16-NPEPL1H3BU86 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
STX16-NPEPL1H3BU86 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
STX16-NPEPL1H3BU86 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
STX16-NPEPL1H3BU86 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
STX16-NPEPL1H3BU86 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
STX16-NPEPL1H3BU86 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
STX16-NPEPL1H3BU86 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
STX16-NPEPL1H3BU86 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
STX16-NPEPL1H3BU86 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
STX16-NPEPL1H3BU86 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
STX16-NPEPL1H3BU86 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
STX16-NPEPL1H3BU86 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC23.91■■□□□ 1.42
STX16-NPEPL1H3BU86 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
STX16-NPEPL1H3BU86 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
STX16-NPEPL1H3BU86 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
STX16-NPEPL1H3BU86 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
STX16-NPEPL1H3BU86 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
STX16-NPEPL1H3BU86 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
STX16-NPEPL1H3BU86 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
STX16-NPEPL1H3BU86 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
STX16-NPEPL1H3BU86 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
STX16-NPEPL1H3BU86 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.6 ms