Protein–RNA interactions for Protein: H3BSU7

TMX2-CTNND1, TMX2-CTNND1 readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMX2-CTNND1H3BSU7 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TMX2-CTNND1H3BSU7 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TMX2-CTNND1H3BSU7 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TMX2-CTNND1H3BSU7 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
TMX2-CTNND1H3BSU7 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TMX2-CTNND1H3BSU7 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TMX2-CTNND1H3BSU7 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TMX2-CTNND1H3BSU7 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TMX2-CTNND1H3BSU7 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
TMX2-CTNND1H3BSU7 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TMX2-CTNND1H3BSU7 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TMX2-CTNND1H3BSU7 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TMX2-CTNND1H3BSU7 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TMX2-CTNND1H3BSU7 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
TMX2-CTNND1H3BSU7 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TMX2-CTNND1H3BSU7 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TMX2-CTNND1H3BSU7 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TMX2-CTNND1H3BSU7 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TMX2-CTNND1H3BSU7 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TMX2-CTNND1H3BSU7 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TMX2-CTNND1H3BSU7 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
TMX2-CTNND1H3BSU7 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TMX2-CTNND1H3BSU7 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
TMX2-CTNND1H3BSU7 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TMX2-CTNND1H3BSU7 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TMX2-CTNND1H3BSU7 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TMX2-CTNND1H3BSU7 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TMX2-CTNND1H3BSU7 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TMX2-CTNND1H3BSU7 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TMX2-CTNND1H3BSU7 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TMX2-CTNND1H3BSU7 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
TMX2-CTNND1H3BSU7 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TMX2-CTNND1H3BSU7 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TMX2-CTNND1H3BSU7 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TMX2-CTNND1H3BSU7 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TMX2-CTNND1H3BSU7 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TMX2-CTNND1H3BSU7 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TMX2-CTNND1H3BSU7 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TMX2-CTNND1H3BSU7 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TMX2-CTNND1H3BSU7 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TMX2-CTNND1H3BSU7 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TMX2-CTNND1H3BSU7 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TMX2-CTNND1H3BSU7 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TMX2-CTNND1H3BSU7 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TMX2-CTNND1H3BSU7 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TMX2-CTNND1H3BSU7 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TMX2-CTNND1H3BSU7 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
TMX2-CTNND1H3BSU7 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
TMX2-CTNND1H3BSU7 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TMX2-CTNND1H3BSU7 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TMX2-CTNND1H3BSU7 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TMX2-CTNND1H3BSU7 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TMX2-CTNND1H3BSU7 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TMX2-CTNND1H3BSU7 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TMX2-CTNND1H3BSU7 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TMX2-CTNND1H3BSU7 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TMX2-CTNND1H3BSU7 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TMX2-CTNND1H3BSU7 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TMX2-CTNND1H3BSU7 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TMX2-CTNND1H3BSU7 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
TMX2-CTNND1H3BSU7 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TMX2-CTNND1H3BSU7 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TMX2-CTNND1H3BSU7 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TMX2-CTNND1H3BSU7 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TMX2-CTNND1H3BSU7 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TMX2-CTNND1H3BSU7 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TMX2-CTNND1H3BSU7 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TMX2-CTNND1H3BSU7 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
TMX2-CTNND1H3BSU7 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TMX2-CTNND1H3BSU7 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TMX2-CTNND1H3BSU7 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TMX2-CTNND1H3BSU7 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
TMX2-CTNND1H3BSU7 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TMX2-CTNND1H3BSU7 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
TMX2-CTNND1H3BSU7 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TMX2-CTNND1H3BSU7 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TMX2-CTNND1H3BSU7 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TMX2-CTNND1H3BSU7 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TMX2-CTNND1H3BSU7 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TMX2-CTNND1H3BSU7 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TMX2-CTNND1H3BSU7 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TMX2-CTNND1H3BSU7 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
TMX2-CTNND1H3BSU7 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TMX2-CTNND1H3BSU7 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TMX2-CTNND1H3BSU7 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TMX2-CTNND1H3BSU7 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TMX2-CTNND1H3BSU7 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TMX2-CTNND1H3BSU7 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TMX2-CTNND1H3BSU7 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TMX2-CTNND1H3BSU7 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TMX2-CTNND1H3BSU7 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TMX2-CTNND1H3BSU7 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TMX2-CTNND1H3BSU7 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TMX2-CTNND1H3BSU7 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TMX2-CTNND1H3BSU7 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TMX2-CTNND1H3BSU7 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TMX2-CTNND1H3BSU7 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
TMX2-CTNND1H3BSU7 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TMX2-CTNND1H3BSU7 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TMX2-CTNND1H3BSU7 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.8 ms