Protein–RNA interactions for Protein: C9JDP6

CLDN25, Putative claudin-25, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN25C9JDP6 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CLDN25C9JDP6 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CLDN25C9JDP6 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CLDN25C9JDP6 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CLDN25C9JDP6 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CLDN25C9JDP6 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CLDN25C9JDP6 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CLDN25C9JDP6 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CLDN25C9JDP6 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CLDN25C9JDP6 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CLDN25C9JDP6 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CLDN25C9JDP6 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CLDN25C9JDP6 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CLDN25C9JDP6 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CLDN25C9JDP6 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CLDN25C9JDP6 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CLDN25C9JDP6 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CLDN25C9JDP6 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CLDN25C9JDP6 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CLDN25C9JDP6 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CLDN25C9JDP6 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CLDN25C9JDP6 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CLDN25C9JDP6 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CLDN25C9JDP6 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CLDN25C9JDP6 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CLDN25C9JDP6 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CLDN25C9JDP6 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CLDN25C9JDP6 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CLDN25C9JDP6 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CLDN25C9JDP6 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CLDN25C9JDP6 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CLDN25C9JDP6 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CLDN25C9JDP6 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CLDN25C9JDP6 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CLDN25C9JDP6 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CLDN25C9JDP6 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CLDN25C9JDP6 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CLDN25C9JDP6 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CLDN25C9JDP6 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CLDN25C9JDP6 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CLDN25C9JDP6 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CLDN25C9JDP6 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CLDN25C9JDP6 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CLDN25C9JDP6 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CLDN25C9JDP6 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CLDN25C9JDP6 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CLDN25C9JDP6 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CLDN25C9JDP6 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CLDN25C9JDP6 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLDN25C9JDP6 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLDN25C9JDP6 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLDN25C9JDP6 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLDN25C9JDP6 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLDN25C9JDP6 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLDN25C9JDP6 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLDN25C9JDP6 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CLDN25C9JDP6 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CLDN25C9JDP6 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CLDN25C9JDP6 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CLDN25C9JDP6 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CLDN25C9JDP6 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CLDN25C9JDP6 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CLDN25C9JDP6 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CLDN25C9JDP6 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CLDN25C9JDP6 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CLDN25C9JDP6 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CLDN25C9JDP6 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CLDN25C9JDP6 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CLDN25C9JDP6 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CLDN25C9JDP6 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CLDN25C9JDP6 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CLDN25C9JDP6 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CLDN25C9JDP6 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CLDN25C9JDP6 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CLDN25C9JDP6 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CLDN25C9JDP6 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CLDN25C9JDP6 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CLDN25C9JDP6 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CLDN25C9JDP6 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CLDN25C9JDP6 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLDN25C9JDP6 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLDN25C9JDP6 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLDN25C9JDP6 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLDN25C9JDP6 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLDN25C9JDP6 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLDN25C9JDP6 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLDN25C9JDP6 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLDN25C9JDP6 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLDN25C9JDP6 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CLDN25C9JDP6 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLDN25C9JDP6 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLDN25C9JDP6 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLDN25C9JDP6 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLDN25C9JDP6 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CLDN25C9JDP6 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CLDN25C9JDP6 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CLDN25C9JDP6 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CLDN25C9JDP6 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CLDN25C9JDP6 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CLDN25C9JDP6 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.7 ms