Protein–RNA interactions for Protein: B4DXG7

cDNA FLJ57652, highly similar to Ephrin-A3, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B4DXG7 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
B4DXG7 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
B4DXG7 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
B4DXG7 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
B4DXG7 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
B4DXG7 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
B4DXG7 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
B4DXG7 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
B4DXG7 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
B4DXG7 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
B4DXG7 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
B4DXG7 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
B4DXG7 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
B4DXG7 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
B4DXG7 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
B4DXG7 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
B4DXG7 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
B4DXG7 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
B4DXG7 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
B4DXG7 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
B4DXG7 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
B4DXG7 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
B4DXG7 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
B4DXG7 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
B4DXG7 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
B4DXG7 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
B4DXG7 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
B4DXG7 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
B4DXG7 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
B4DXG7 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
B4DXG7 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
B4DXG7 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
B4DXG7 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
B4DXG7 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
B4DXG7 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
B4DXG7 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
B4DXG7 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
B4DXG7 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
B4DXG7 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
B4DXG7 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
B4DXG7 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
B4DXG7 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
B4DXG7 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
B4DXG7 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
B4DXG7 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
B4DXG7 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
B4DXG7 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
B4DXG7 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
B4DXG7 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
B4DXG7 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
B4DXG7 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
B4DXG7 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
B4DXG7 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
B4DXG7 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
B4DXG7 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
B4DXG7 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
B4DXG7 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
B4DXG7 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
B4DXG7 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
B4DXG7 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
B4DXG7 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
B4DXG7 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
B4DXG7 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
B4DXG7 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
B4DXG7 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
B4DXG7 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
B4DXG7 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
B4DXG7 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
B4DXG7 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
B4DXG7 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
B4DXG7 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
B4DXG7 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
B4DXG7 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
B4DXG7 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
B4DXG7 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
B4DXG7 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
B4DXG7 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
B4DXG7 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
B4DXG7 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
B4DXG7 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
B4DXG7 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
B4DXG7 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
B4DXG7 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
B4DXG7 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
B4DXG7 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
B4DXG7 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
B4DXG7 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
B4DXG7 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
B4DXG7 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
B4DXG7 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
B4DXG7 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
B4DXG7 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
B4DXG7 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
B4DXG7 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
B4DXG7 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
B4DXG7 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
B4DXG7 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
B4DXG7 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
B4DXG7 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
B4DXG7 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms