Protein–RNA interactions for Protein: B1AMM8

LINC00587, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00587, humanhuman

Predictions only

Length 73 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00587B1AMM8 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
LINC00587B1AMM8 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
LINC00587B1AMM8 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
LINC00587B1AMM8 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
LINC00587B1AMM8 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
LINC00587B1AMM8 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
LINC00587B1AMM8 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
LINC00587B1AMM8 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
LINC00587B1AMM8 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
LINC00587B1AMM8 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
LINC00587B1AMM8 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
LINC00587B1AMM8 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
LINC00587B1AMM8 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
LINC00587B1AMM8 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
LINC00587B1AMM8 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
LINC00587B1AMM8 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
LINC00587B1AMM8 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
LINC00587B1AMM8 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
LINC00587B1AMM8 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
LINC00587B1AMM8 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
LINC00587B1AMM8 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
LINC00587B1AMM8 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
LINC00587B1AMM8 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
LINC00587B1AMM8 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
LINC00587B1AMM8 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
LINC00587B1AMM8 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
LINC00587B1AMM8 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
LINC00587B1AMM8 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
LINC00587B1AMM8 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
LINC00587B1AMM8 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
LINC00587B1AMM8 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
LINC00587B1AMM8 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
LINC00587B1AMM8 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
LINC00587B1AMM8 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
LINC00587B1AMM8 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
LINC00587B1AMM8 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
LINC00587B1AMM8 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
LINC00587B1AMM8 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
LINC00587B1AMM8 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
LINC00587B1AMM8 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
LINC00587B1AMM8 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
LINC00587B1AMM8 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
LINC00587B1AMM8 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
LINC00587B1AMM8 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
LINC00587B1AMM8 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
LINC00587B1AMM8 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
LINC00587B1AMM8 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
LINC00587B1AMM8 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
LINC00587B1AMM8 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LINC00587B1AMM8 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LINC00587B1AMM8 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
LINC00587B1AMM8 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LINC00587B1AMM8 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LINC00587B1AMM8 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
LINC00587B1AMM8 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
LINC00587B1AMM8 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
LINC00587B1AMM8 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
LINC00587B1AMM8 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
LINC00587B1AMM8 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
LINC00587B1AMM8 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
LINC00587B1AMM8 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
LINC00587B1AMM8 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
LINC00587B1AMM8 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
LINC00587B1AMM8 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
LINC00587B1AMM8 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
LINC00587B1AMM8 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
LINC00587B1AMM8 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
LINC00587B1AMM8 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
LINC00587B1AMM8 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
LINC00587B1AMM8 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
LINC00587B1AMM8 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
LINC00587B1AMM8 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
LINC00587B1AMM8 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
LINC00587B1AMM8 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
LINC00587B1AMM8 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
LINC00587B1AMM8 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
LINC00587B1AMM8 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
LINC00587B1AMM8 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LINC00587B1AMM8 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
LINC00587B1AMM8 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LINC00587B1AMM8 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LINC00587B1AMM8 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
LINC00587B1AMM8 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LINC00587B1AMM8 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
LINC00587B1AMM8 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
LINC00587B1AMM8 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
LINC00587B1AMM8 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
LINC00587B1AMM8 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LINC00587B1AMM8 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LINC00587B1AMM8 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LINC00587B1AMM8 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
LINC00587B1AMM8 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LINC00587B1AMM8 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
LINC00587B1AMM8 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
LINC00587B1AMM8 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
LINC00587B1AMM8 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
LINC00587B1AMM8 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
LINC00587B1AMM8 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
LINC00587B1AMM8 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LINC00587B1AMM8 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.2 ms