Protein–RNA interactions for Protein: A8KAH6

HSPB2, Heat shock 27kDa protein 2, isoform CRA_a, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSPB2A8KAH6 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HSPB2A8KAH6 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HSPB2A8KAH6 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HSPB2A8KAH6 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HSPB2A8KAH6 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HSPB2A8KAH6 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HSPB2A8KAH6 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HSPB2A8KAH6 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HSPB2A8KAH6 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HSPB2A8KAH6 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HSPB2A8KAH6 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HSPB2A8KAH6 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HSPB2A8KAH6 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HSPB2A8KAH6 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HSPB2A8KAH6 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HSPB2A8KAH6 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HSPB2A8KAH6 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HSPB2A8KAH6 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HSPB2A8KAH6 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HSPB2A8KAH6 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HSPB2A8KAH6 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HSPB2A8KAH6 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HSPB2A8KAH6 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HSPB2A8KAH6 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HSPB2A8KAH6 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HSPB2A8KAH6 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
HSPB2A8KAH6 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
HSPB2A8KAH6 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HSPB2A8KAH6 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HSPB2A8KAH6 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HSPB2A8KAH6 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HSPB2A8KAH6 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HSPB2A8KAH6 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HSPB2A8KAH6 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HSPB2A8KAH6 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HSPB2A8KAH6 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HSPB2A8KAH6 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HSPB2A8KAH6 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HSPB2A8KAH6 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HSPB2A8KAH6 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
HSPB2A8KAH6 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HSPB2A8KAH6 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HSPB2A8KAH6 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HSPB2A8KAH6 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HSPB2A8KAH6 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HSPB2A8KAH6 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
HSPB2A8KAH6 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HSPB2A8KAH6 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HSPB2A8KAH6 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HSPB2A8KAH6 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HSPB2A8KAH6 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HSPB2A8KAH6 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HSPB2A8KAH6 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HSPB2A8KAH6 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HSPB2A8KAH6 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
HSPB2A8KAH6 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
HSPB2A8KAH6 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HSPB2A8KAH6 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HSPB2A8KAH6 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HSPB2A8KAH6 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HSPB2A8KAH6 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HSPB2A8KAH6 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
HSPB2A8KAH6 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HSPB2A8KAH6 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HSPB2A8KAH6 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HSPB2A8KAH6 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
HSPB2A8KAH6 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HSPB2A8KAH6 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HSPB2A8KAH6 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HSPB2A8KAH6 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HSPB2A8KAH6 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HSPB2A8KAH6 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HSPB2A8KAH6 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HSPB2A8KAH6 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HSPB2A8KAH6 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HSPB2A8KAH6 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
HSPB2A8KAH6 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
HSPB2A8KAH6 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HSPB2A8KAH6 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HSPB2A8KAH6 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HSPB2A8KAH6 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HSPB2A8KAH6 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HSPB2A8KAH6 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HSPB2A8KAH6 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HSPB2A8KAH6 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HSPB2A8KAH6 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HSPB2A8KAH6 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
HSPB2A8KAH6 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
HSPB2A8KAH6 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HSPB2A8KAH6 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HSPB2A8KAH6 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HSPB2A8KAH6 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HSPB2A8KAH6 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HSPB2A8KAH6 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HSPB2A8KAH6 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HSPB2A8KAH6 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HSPB2A8KAH6 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HSPB2A8KAH6 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HSPB2A8KAH6 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HSPB2A8KAH6 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.4 ms