Protein–RNA interactions for Protein: A6NMK7

CPSF4L, Putative cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 4-like protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPSF4LA6NMK7 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CPSF4LA6NMK7 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CPSF4LA6NMK7 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CPSF4LA6NMK7 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CPSF4LA6NMK7 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CPSF4LA6NMK7 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CPSF4LA6NMK7 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CPSF4LA6NMK7 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CPSF4LA6NMK7 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CPSF4LA6NMK7 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CPSF4LA6NMK7 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CPSF4LA6NMK7 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CPSF4LA6NMK7 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CPSF4LA6NMK7 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CPSF4LA6NMK7 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CPSF4LA6NMK7 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CPSF4LA6NMK7 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CPSF4LA6NMK7 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.52■■□□□ 1.19
CPSF4LA6NMK7 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
CPSF4LA6NMK7 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CPSF4LA6NMK7 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CPSF4LA6NMK7 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CPSF4LA6NMK7 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CPSF4LA6NMK7 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CPSF4LA6NMK7 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CPSF4LA6NMK7 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CPSF4LA6NMK7 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CPSF4LA6NMK7 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CPSF4LA6NMK7 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CPSF4LA6NMK7 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CPSF4LA6NMK7 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CPSF4LA6NMK7 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CPSF4LA6NMK7 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CPSF4LA6NMK7 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CPSF4LA6NMK7 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CPSF4LA6NMK7 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CPSF4LA6NMK7 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CPSF4LA6NMK7 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CPSF4LA6NMK7 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CPSF4LA6NMK7 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CPSF4LA6NMK7 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CPSF4LA6NMK7 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CPSF4LA6NMK7 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CPSF4LA6NMK7 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CPSF4LA6NMK7 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CPSF4LA6NMK7 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CPSF4LA6NMK7 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CPSF4LA6NMK7 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CPSF4LA6NMK7 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CPSF4LA6NMK7 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CPSF4LA6NMK7 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CPSF4LA6NMK7 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CPSF4LA6NMK7 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CPSF4LA6NMK7 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CPSF4LA6NMK7 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CPSF4LA6NMK7 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CPSF4LA6NMK7 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CPSF4LA6NMK7 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CPSF4LA6NMK7 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CPSF4LA6NMK7 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CPSF4LA6NMK7 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CPSF4LA6NMK7 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CPSF4LA6NMK7 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CPSF4LA6NMK7 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CPSF4LA6NMK7 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CPSF4LA6NMK7 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CPSF4LA6NMK7 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CPSF4LA6NMK7 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CPSF4LA6NMK7 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CPSF4LA6NMK7 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CPSF4LA6NMK7 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CPSF4LA6NMK7 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CPSF4LA6NMK7 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CPSF4LA6NMK7 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CPSF4LA6NMK7 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CPSF4LA6NMK7 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CPSF4LA6NMK7 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CPSF4LA6NMK7 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CPSF4LA6NMK7 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CPSF4LA6NMK7 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CPSF4LA6NMK7 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CPSF4LA6NMK7 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CPSF4LA6NMK7 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CPSF4LA6NMK7 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CPSF4LA6NMK7 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CPSF4LA6NMK7 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CPSF4LA6NMK7 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CPSF4LA6NMK7 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CPSF4LA6NMK7 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CPSF4LA6NMK7 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CPSF4LA6NMK7 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CPSF4LA6NMK7 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CPSF4LA6NMK7 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CPSF4LA6NMK7 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CPSF4LA6NMK7 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CPSF4LA6NMK7 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CPSF4LA6NMK7 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CPSF4LA6NMK7 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CPSF4LA6NMK7 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CPSF4LA6NMK7 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms