Protein–RNA interactions for Protein: A6NDN3

GOLGA6B, Golgin subfamily A member 6B, humanhuman

Predictions only

Length 693 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA6BA6NDN3 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
GOLGA6BA6NDN3 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
GOLGA6BA6NDN3 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
GOLGA6BA6NDN3 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
GOLGA6BA6NDN3 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
GOLGA6BA6NDN3 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
GOLGA6BA6NDN3 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
GOLGA6BA6NDN3 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
GOLGA6BA6NDN3 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
GOLGA6BA6NDN3 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
GOLGA6BA6NDN3 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
GOLGA6BA6NDN3 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
GOLGA6BA6NDN3 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
GOLGA6BA6NDN3 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
GOLGA6BA6NDN3 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
GOLGA6BA6NDN3 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
GOLGA6BA6NDN3 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
GOLGA6BA6NDN3 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
GOLGA6BA6NDN3 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
GOLGA6BA6NDN3 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
GOLGA6BA6NDN3 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
GOLGA6BA6NDN3 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
GOLGA6BA6NDN3 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
GOLGA6BA6NDN3 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
GOLGA6BA6NDN3 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
GOLGA6BA6NDN3 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
GOLGA6BA6NDN3 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
GOLGA6BA6NDN3 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
GOLGA6BA6NDN3 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
GOLGA6BA6NDN3 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
GOLGA6BA6NDN3 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
GOLGA6BA6NDN3 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
GOLGA6BA6NDN3 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
GOLGA6BA6NDN3 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
GOLGA6BA6NDN3 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
GOLGA6BA6NDN3 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
GOLGA6BA6NDN3 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
GOLGA6BA6NDN3 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
GOLGA6BA6NDN3 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
GOLGA6BA6NDN3 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
GOLGA6BA6NDN3 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
GOLGA6BA6NDN3 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
GOLGA6BA6NDN3 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
GOLGA6BA6NDN3 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
GOLGA6BA6NDN3 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
GOLGA6BA6NDN3 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
GOLGA6BA6NDN3 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
GOLGA6BA6NDN3 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
GOLGA6BA6NDN3 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
GOLGA6BA6NDN3 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
GOLGA6BA6NDN3 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
GOLGA6BA6NDN3 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
GOLGA6BA6NDN3 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
GOLGA6BA6NDN3 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
GOLGA6BA6NDN3 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
GOLGA6BA6NDN3 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
GOLGA6BA6NDN3 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
GOLGA6BA6NDN3 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
GOLGA6BA6NDN3 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
GOLGA6BA6NDN3 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
GOLGA6BA6NDN3 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
GOLGA6BA6NDN3 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
GOLGA6BA6NDN3 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
GOLGA6BA6NDN3 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
GOLGA6BA6NDN3 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
GOLGA6BA6NDN3 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
GOLGA6BA6NDN3 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
GOLGA6BA6NDN3 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
GOLGA6BA6NDN3 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
GOLGA6BA6NDN3 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC25.63■■□□□ 1.69
GOLGA6BA6NDN3 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
GOLGA6BA6NDN3 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
GOLGA6BA6NDN3 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
GOLGA6BA6NDN3 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
GOLGA6BA6NDN3 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
GOLGA6BA6NDN3 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
GOLGA6BA6NDN3 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
GOLGA6BA6NDN3 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
GOLGA6BA6NDN3 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
GOLGA6BA6NDN3 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
GOLGA6BA6NDN3 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC25.61■■□□□ 1.69
GOLGA6BA6NDN3 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
GOLGA6BA6NDN3 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
GOLGA6BA6NDN3 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
GOLGA6BA6NDN3 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
GOLGA6BA6NDN3 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
GOLGA6BA6NDN3 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
GOLGA6BA6NDN3 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
GOLGA6BA6NDN3 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
GOLGA6BA6NDN3 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
GOLGA6BA6NDN3 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
GOLGA6BA6NDN3 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
GOLGA6BA6NDN3 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
GOLGA6BA6NDN3 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
GOLGA6BA6NDN3 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
GOLGA6BA6NDN3 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
GOLGA6BA6NDN3 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
GOLGA6BA6NDN3 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
GOLGA6BA6NDN3 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
GOLGA6BA6NDN3 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.5 ms