Protein–RNA interactions for Protein: A2A3K4

PTPDC1, Protein tyrosine phosphatase domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 754 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPDC1A2A3K4 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
PTPDC1A2A3K4 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
PTPDC1A2A3K4 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
PTPDC1A2A3K4 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
PTPDC1A2A3K4 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
PTPDC1A2A3K4 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
PTPDC1A2A3K4 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
PTPDC1A2A3K4 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
PTPDC1A2A3K4 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
PTPDC1A2A3K4 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
PTPDC1A2A3K4 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
PTPDC1A2A3K4 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
PTPDC1A2A3K4 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
PTPDC1A2A3K4 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
PTPDC1A2A3K4 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC28.91■■■□□ 2.22
PTPDC1A2A3K4 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
PTPDC1A2A3K4 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
PTPDC1A2A3K4 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
PTPDC1A2A3K4 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
PTPDC1A2A3K4 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
PTPDC1A2A3K4 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
PTPDC1A2A3K4 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
PTPDC1A2A3K4 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
PTPDC1A2A3K4 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
PTPDC1A2A3K4 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
PTPDC1A2A3K4 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
PTPDC1A2A3K4 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
PTPDC1A2A3K4 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
PTPDC1A2A3K4 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
PTPDC1A2A3K4 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
PTPDC1A2A3K4 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
PTPDC1A2A3K4 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
PTPDC1A2A3K4 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
PTPDC1A2A3K4 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
PTPDC1A2A3K4 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
PTPDC1A2A3K4 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
PTPDC1A2A3K4 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
PTPDC1A2A3K4 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
PTPDC1A2A3K4 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
PTPDC1A2A3K4 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
PTPDC1A2A3K4 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
PTPDC1A2A3K4 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
PTPDC1A2A3K4 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
PTPDC1A2A3K4 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
PTPDC1A2A3K4 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
PTPDC1A2A3K4 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
PTPDC1A2A3K4 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
PTPDC1A2A3K4 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
PTPDC1A2A3K4 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
PTPDC1A2A3K4 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
PTPDC1A2A3K4 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
PTPDC1A2A3K4 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
PTPDC1A2A3K4 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
PTPDC1A2A3K4 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
PTPDC1A2A3K4 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
PTPDC1A2A3K4 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
PTPDC1A2A3K4 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
PTPDC1A2A3K4 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
PTPDC1A2A3K4 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
PTPDC1A2A3K4 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
PTPDC1A2A3K4 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
PTPDC1A2A3K4 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
PTPDC1A2A3K4 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
PTPDC1A2A3K4 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
PTPDC1A2A3K4 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
PTPDC1A2A3K4 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
PTPDC1A2A3K4 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
PTPDC1A2A3K4 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
PTPDC1A2A3K4 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
PTPDC1A2A3K4 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
PTPDC1A2A3K4 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
PTPDC1A2A3K4 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
PTPDC1A2A3K4 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
PTPDC1A2A3K4 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
PTPDC1A2A3K4 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
PTPDC1A2A3K4 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
PTPDC1A2A3K4 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
PTPDC1A2A3K4 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
PTPDC1A2A3K4 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
PTPDC1A2A3K4 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
PTPDC1A2A3K4 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
PTPDC1A2A3K4 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
PTPDC1A2A3K4 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
PTPDC1A2A3K4 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
PTPDC1A2A3K4 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
PTPDC1A2A3K4 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
PTPDC1A2A3K4 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
PTPDC1A2A3K4 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
PTPDC1A2A3K4 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
PTPDC1A2A3K4 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
PTPDC1A2A3K4 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
PTPDC1A2A3K4 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
PTPDC1A2A3K4 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
PTPDC1A2A3K4 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
PTPDC1A2A3K4 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
PTPDC1A2A3K4 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
PTPDC1A2A3K4 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC28.72■■■□□ 2.19
PTPDC1A2A3K4 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
PTPDC1A2A3K4 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
PTPDC1A2A3K4 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.8 ms