Protein–RNA interactions for Protein: A0AVF1

TTC26, Intraflagellar transport protein 56, humanhuman

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Length 554 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC26A0AVF1 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC27.18■■□□□ 1.94
TTC26A0AVF1 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
TTC26A0AVF1 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
TTC26A0AVF1 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TTC26A0AVF1 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TTC26A0AVF1 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
TTC26A0AVF1 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TTC26A0AVF1 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
TTC26A0AVF1 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TTC26A0AVF1 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TTC26A0AVF1 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TTC26A0AVF1 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC27.17■■□□□ 1.94
TTC26A0AVF1 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
TTC26A0AVF1 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
TTC26A0AVF1 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
TTC26A0AVF1 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
TTC26A0AVF1 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
TTC26A0AVF1 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
TTC26A0AVF1 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TTC26A0AVF1 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
TTC26A0AVF1 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
TTC26A0AVF1 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TTC26A0AVF1 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TTC26A0AVF1 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TTC26A0AVF1 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
TTC26A0AVF1 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
TTC26A0AVF1 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
TTC26A0AVF1 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
TTC26A0AVF1 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
TTC26A0AVF1 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
TTC26A0AVF1 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
TTC26A0AVF1 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
TTC26A0AVF1 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
TTC26A0AVF1 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
TTC26A0AVF1 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
TTC26A0AVF1 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
TTC26A0AVF1 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
TTC26A0AVF1 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
TTC26A0AVF1 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
TTC26A0AVF1 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
TTC26A0AVF1 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
TTC26A0AVF1 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
TTC26A0AVF1 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TTC26A0AVF1 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
TTC26A0AVF1 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TTC26A0AVF1 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
TTC26A0AVF1 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TTC26A0AVF1 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
TTC26A0AVF1 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
TTC26A0AVF1 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TTC26A0AVF1 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TTC26A0AVF1 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TTC26A0AVF1 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
TTC26A0AVF1 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TTC26A0AVF1 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TTC26A0AVF1 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
TTC26A0AVF1 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
TTC26A0AVF1 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
TTC26A0AVF1 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
TTC26A0AVF1 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TTC26A0AVF1 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TTC26A0AVF1 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TTC26A0AVF1 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
TTC26A0AVF1 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
TTC26A0AVF1 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
TTC26A0AVF1 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
TTC26A0AVF1 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TTC26A0AVF1 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TTC26A0AVF1 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
TTC26A0AVF1 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
TTC26A0AVF1 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TTC26A0AVF1 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TTC26A0AVF1 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TTC26A0AVF1 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TTC26A0AVF1 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TTC26A0AVF1 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
TTC26A0AVF1 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TTC26A0AVF1 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
TTC26A0AVF1 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TTC26A0AVF1 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TTC26A0AVF1 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
TTC26A0AVF1 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TTC26A0AVF1 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
TTC26A0AVF1 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TTC26A0AVF1 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
TTC26A0AVF1 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TTC26A0AVF1 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
TTC26A0AVF1 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
TTC26A0AVF1 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TTC26A0AVF1 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TTC26A0AVF1 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC27.01■■□□□ 1.92
TTC26A0AVF1 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
TTC26A0AVF1 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
TTC26A0AVF1 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
TTC26A0AVF1 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
TTC26A0AVF1 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TTC26A0AVF1 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
TTC26A0AVF1 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
TTC26A0AVF1 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TTC26A0AVF1 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
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