Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6Q1

CAPN6, Calpain-6, humanhuman

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Length 641 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN6Q9Y6Q1 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CAPN6Q9Y6Q1 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CAPN6Q9Y6Q1 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CAPN6Q9Y6Q1 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CAPN6Q9Y6Q1 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CAPN6Q9Y6Q1 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CAPN6Q9Y6Q1 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CAPN6Q9Y6Q1 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CAPN6Q9Y6Q1 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CAPN6Q9Y6Q1 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
CAPN6Q9Y6Q1 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CAPN6Q9Y6Q1 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CAPN6Q9Y6Q1 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CAPN6Q9Y6Q1 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CAPN6Q9Y6Q1 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CAPN6Q9Y6Q1 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CAPN6Q9Y6Q1 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CAPN6Q9Y6Q1 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CAPN6Q9Y6Q1 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CAPN6Q9Y6Q1 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CAPN6Q9Y6Q1 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CAPN6Q9Y6Q1 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CAPN6Q9Y6Q1 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CAPN6Q9Y6Q1 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CAPN6Q9Y6Q1 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CAPN6Q9Y6Q1 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
CAPN6Q9Y6Q1 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CAPN6Q9Y6Q1 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CAPN6Q9Y6Q1 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CAPN6Q9Y6Q1 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CAPN6Q9Y6Q1 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CAPN6Q9Y6Q1 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CAPN6Q9Y6Q1 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CAPN6Q9Y6Q1 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CAPN6Q9Y6Q1 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CAPN6Q9Y6Q1 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CAPN6Q9Y6Q1 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CAPN6Q9Y6Q1 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CAPN6Q9Y6Q1 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CAPN6Q9Y6Q1 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CAPN6Q9Y6Q1 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CAPN6Q9Y6Q1 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CAPN6Q9Y6Q1 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CAPN6Q9Y6Q1 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CAPN6Q9Y6Q1 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CAPN6Q9Y6Q1 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
CAPN6Q9Y6Q1 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CAPN6Q9Y6Q1 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CAPN6Q9Y6Q1 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CAPN6Q9Y6Q1 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
CAPN6Q9Y6Q1 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CAPN6Q9Y6Q1 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CAPN6Q9Y6Q1 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CAPN6Q9Y6Q1 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CAPN6Q9Y6Q1 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CAPN6Q9Y6Q1 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CAPN6Q9Y6Q1 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CAPN6Q9Y6Q1 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CAPN6Q9Y6Q1 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CAPN6Q9Y6Q1 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CAPN6Q9Y6Q1 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CAPN6Q9Y6Q1 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CAPN6Q9Y6Q1 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CAPN6Q9Y6Q1 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CAPN6Q9Y6Q1 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CAPN6Q9Y6Q1 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CAPN6Q9Y6Q1 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CAPN6Q9Y6Q1 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CAPN6Q9Y6Q1 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CAPN6Q9Y6Q1 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CAPN6Q9Y6Q1 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CAPN6Q9Y6Q1 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CAPN6Q9Y6Q1 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CAPN6Q9Y6Q1 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
CAPN6Q9Y6Q1 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
CAPN6Q9Y6Q1 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
CAPN6Q9Y6Q1 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CAPN6Q9Y6Q1 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CAPN6Q9Y6Q1 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CAPN6Q9Y6Q1 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CAPN6Q9Y6Q1 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CAPN6Q9Y6Q1 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CAPN6Q9Y6Q1 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CAPN6Q9Y6Q1 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CAPN6Q9Y6Q1 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CAPN6Q9Y6Q1 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CAPN6Q9Y6Q1 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CAPN6Q9Y6Q1 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CAPN6Q9Y6Q1 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CAPN6Q9Y6Q1 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CAPN6Q9Y6Q1 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CAPN6Q9Y6Q1 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CAPN6Q9Y6Q1 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CAPN6Q9Y6Q1 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CAPN6Q9Y6Q1 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CAPN6Q9Y6Q1 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CAPN6Q9Y6Q1 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CAPN6Q9Y6Q1 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CAPN6Q9Y6Q1 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CAPN6Q9Y6Q1 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
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