Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6F1

PARP3, Poly [ADP-ribose] polymerase 3, humanhuman

Predictions only

Length 533 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PARP3Q9Y6F1 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PARP3Q9Y6F1 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PARP3Q9Y6F1 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PARP3Q9Y6F1 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PARP3Q9Y6F1 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
PARP3Q9Y6F1 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PARP3Q9Y6F1 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PARP3Q9Y6F1 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PARP3Q9Y6F1 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
PARP3Q9Y6F1 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PARP3Q9Y6F1 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
PARP3Q9Y6F1 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PARP3Q9Y6F1 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PARP3Q9Y6F1 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PARP3Q9Y6F1 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PARP3Q9Y6F1 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PARP3Q9Y6F1 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PARP3Q9Y6F1 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PARP3Q9Y6F1 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PARP3Q9Y6F1 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PARP3Q9Y6F1 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PARP3Q9Y6F1 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PARP3Q9Y6F1 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PARP3Q9Y6F1 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PARP3Q9Y6F1 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PARP3Q9Y6F1 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PARP3Q9Y6F1 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PARP3Q9Y6F1 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PARP3Q9Y6F1 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PARP3Q9Y6F1 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PARP3Q9Y6F1 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PARP3Q9Y6F1 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PARP3Q9Y6F1 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PARP3Q9Y6F1 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
PARP3Q9Y6F1 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PARP3Q9Y6F1 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PARP3Q9Y6F1 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PARP3Q9Y6F1 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PARP3Q9Y6F1 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PARP3Q9Y6F1 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PARP3Q9Y6F1 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PARP3Q9Y6F1 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PARP3Q9Y6F1 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PARP3Q9Y6F1 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
PARP3Q9Y6F1 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PARP3Q9Y6F1 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
PARP3Q9Y6F1 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
PARP3Q9Y6F1 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PARP3Q9Y6F1 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PARP3Q9Y6F1 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PARP3Q9Y6F1 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PARP3Q9Y6F1 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PARP3Q9Y6F1 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PARP3Q9Y6F1 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PARP3Q9Y6F1 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PARP3Q9Y6F1 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PARP3Q9Y6F1 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PARP3Q9Y6F1 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PARP3Q9Y6F1 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PARP3Q9Y6F1 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PARP3Q9Y6F1 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PARP3Q9Y6F1 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PARP3Q9Y6F1 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PARP3Q9Y6F1 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PARP3Q9Y6F1 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PARP3Q9Y6F1 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PARP3Q9Y6F1 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
PARP3Q9Y6F1 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PARP3Q9Y6F1 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
PARP3Q9Y6F1 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PARP3Q9Y6F1 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PARP3Q9Y6F1 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PARP3Q9Y6F1 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PARP3Q9Y6F1 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PARP3Q9Y6F1 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PARP3Q9Y6F1 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PARP3Q9Y6F1 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PARP3Q9Y6F1 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
PARP3Q9Y6F1 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PARP3Q9Y6F1 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PARP3Q9Y6F1 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PARP3Q9Y6F1 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PARP3Q9Y6F1 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PARP3Q9Y6F1 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PARP3Q9Y6F1 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
PARP3Q9Y6F1 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PARP3Q9Y6F1 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PARP3Q9Y6F1 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PARP3Q9Y6F1 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PARP3Q9Y6F1 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
PARP3Q9Y6F1 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PARP3Q9Y6F1 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
PARP3Q9Y6F1 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
PARP3Q9Y6F1 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PARP3Q9Y6F1 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PARP3Q9Y6F1 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PARP3Q9Y6F1 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PARP3Q9Y6F1 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PARP3Q9Y6F1 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PARP3Q9Y6F1 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
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