Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5Q9

GTF3C3, General transcription factor 3C polypeptide 3, humanhuman

Predictions only

Length 886 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C3Q9Y5Q9 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
GTF3C3Q9Y5Q9 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GTF3C3Q9Y5Q9 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
GTF3C3Q9Y5Q9 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GTF3C3Q9Y5Q9 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GTF3C3Q9Y5Q9 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GTF3C3Q9Y5Q9 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
GTF3C3Q9Y5Q9 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
GTF3C3Q9Y5Q9 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GTF3C3Q9Y5Q9 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
GTF3C3Q9Y5Q9 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
GTF3C3Q9Y5Q9 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GTF3C3Q9Y5Q9 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GTF3C3Q9Y5Q9 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GTF3C3Q9Y5Q9 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GTF3C3Q9Y5Q9 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GTF3C3Q9Y5Q9 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
GTF3C3Q9Y5Q9 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
GTF3C3Q9Y5Q9 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GTF3C3Q9Y5Q9 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GTF3C3Q9Y5Q9 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GTF3C3Q9Y5Q9 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
GTF3C3Q9Y5Q9 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GTF3C3Q9Y5Q9 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GTF3C3Q9Y5Q9 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
GTF3C3Q9Y5Q9 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
GTF3C3Q9Y5Q9 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC23.81■■□□□ 1.4
GTF3C3Q9Y5Q9 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GTF3C3Q9Y5Q9 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
GTF3C3Q9Y5Q9 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GTF3C3Q9Y5Q9 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GTF3C3Q9Y5Q9 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GTF3C3Q9Y5Q9 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GTF3C3Q9Y5Q9 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
GTF3C3Q9Y5Q9 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GTF3C3Q9Y5Q9 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GTF3C3Q9Y5Q9 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
GTF3C3Q9Y5Q9 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GTF3C3Q9Y5Q9 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GTF3C3Q9Y5Q9 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GTF3C3Q9Y5Q9 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
GTF3C3Q9Y5Q9 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
GTF3C3Q9Y5Q9 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
GTF3C3Q9Y5Q9 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
GTF3C3Q9Y5Q9 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
GTF3C3Q9Y5Q9 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
GTF3C3Q9Y5Q9 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
GTF3C3Q9Y5Q9 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
GTF3C3Q9Y5Q9 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
GTF3C3Q9Y5Q9 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
GTF3C3Q9Y5Q9 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
GTF3C3Q9Y5Q9 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
GTF3C3Q9Y5Q9 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
GTF3C3Q9Y5Q9 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
GTF3C3Q9Y5Q9 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
GTF3C3Q9Y5Q9 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
GTF3C3Q9Y5Q9 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
GTF3C3Q9Y5Q9 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
GTF3C3Q9Y5Q9 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
GTF3C3Q9Y5Q9 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
GTF3C3Q9Y5Q9 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
GTF3C3Q9Y5Q9 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
GTF3C3Q9Y5Q9 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
GTF3C3Q9Y5Q9 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GTF3C3Q9Y5Q9 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
GTF3C3Q9Y5Q9 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
GTF3C3Q9Y5Q9 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
GTF3C3Q9Y5Q9 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GTF3C3Q9Y5Q9 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GTF3C3Q9Y5Q9 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GTF3C3Q9Y5Q9 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
GTF3C3Q9Y5Q9 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GTF3C3Q9Y5Q9 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GTF3C3Q9Y5Q9 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GTF3C3Q9Y5Q9 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GTF3C3Q9Y5Q9 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GTF3C3Q9Y5Q9 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GTF3C3Q9Y5Q9 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GTF3C3Q9Y5Q9 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
GTF3C3Q9Y5Q9 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GTF3C3Q9Y5Q9 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GTF3C3Q9Y5Q9 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GTF3C3Q9Y5Q9 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
GTF3C3Q9Y5Q9 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
GTF3C3Q9Y5Q9 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GTF3C3Q9Y5Q9 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GTF3C3Q9Y5Q9 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
GTF3C3Q9Y5Q9 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GTF3C3Q9Y5Q9 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GTF3C3Q9Y5Q9 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GTF3C3Q9Y5Q9 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GTF3C3Q9Y5Q9 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
GTF3C3Q9Y5Q9 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GTF3C3Q9Y5Q9 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GTF3C3Q9Y5Q9 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GTF3C3Q9Y5Q9 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
GTF3C3Q9Y5Q9 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GTF3C3Q9Y5Q9 IRAK1-203ENST00000369980 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GTF3C3Q9Y5Q9 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GTF3C3Q9Y5Q9 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms