Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4D8

HECTD4, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HECTD4, humanhuman

Predictions only

Length 3,996 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HECTD4Q9Y4D8 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
HECTD4Q9Y4D8 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
HECTD4Q9Y4D8 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
HECTD4Q9Y4D8 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
HECTD4Q9Y4D8 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
HECTD4Q9Y4D8 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC11.63□□□□□ -0.55
HECTD4Q9Y4D8 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
HECTD4Q9Y4D8 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC11.63□□□□□ -0.55
HECTD4Q9Y4D8 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
HECTD4Q9Y4D8 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
HECTD4Q9Y4D8 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
HECTD4Q9Y4D8 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
HECTD4Q9Y4D8 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
HECTD4Q9Y4D8 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
HECTD4Q9Y4D8 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
HECTD4Q9Y4D8 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
HECTD4Q9Y4D8 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
HECTD4Q9Y4D8 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
HECTD4Q9Y4D8 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
HECTD4Q9Y4D8 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
HECTD4Q9Y4D8 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
HECTD4Q9Y4D8 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
HECTD4Q9Y4D8 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
HECTD4Q9Y4D8 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
HECTD4Q9Y4D8 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
HECTD4Q9Y4D8 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
HECTD4Q9Y4D8 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
HECTD4Q9Y4D8 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
HECTD4Q9Y4D8 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
HECTD4Q9Y4D8 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
HECTD4Q9Y4D8 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
HECTD4Q9Y4D8 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
HECTD4Q9Y4D8 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
HECTD4Q9Y4D8 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
HECTD4Q9Y4D8 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
HECTD4Q9Y4D8 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
HECTD4Q9Y4D8 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
HECTD4Q9Y4D8 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
HECTD4Q9Y4D8 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
HECTD4Q9Y4D8 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
HECTD4Q9Y4D8 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
HECTD4Q9Y4D8 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
HECTD4Q9Y4D8 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
HECTD4Q9Y4D8 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
HECTD4Q9Y4D8 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
HECTD4Q9Y4D8 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
HECTD4Q9Y4D8 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
HECTD4Q9Y4D8 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
HECTD4Q9Y4D8 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
HECTD4Q9Y4D8 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
HECTD4Q9Y4D8 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC11.62□□□□□ -0.55
HECTD4Q9Y4D8 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC11.62□□□□□ -0.55
HECTD4Q9Y4D8 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
HECTD4Q9Y4D8 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
HECTD4Q9Y4D8 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
HECTD4Q9Y4D8 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
HECTD4Q9Y4D8 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
HECTD4Q9Y4D8 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
HECTD4Q9Y4D8 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
HECTD4Q9Y4D8 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
HECTD4Q9Y4D8 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
HECTD4Q9Y4D8 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
HECTD4Q9Y4D8 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
HECTD4Q9Y4D8 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
HECTD4Q9Y4D8 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
HECTD4Q9Y4D8 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
HECTD4Q9Y4D8 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
HECTD4Q9Y4D8 H2AFV-206ENST00000437072 589 ntTSL 4 BASIC11.61□□□□□ -0.55
HECTD4Q9Y4D8 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
HECTD4Q9Y4D8 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
HECTD4Q9Y4D8 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
HECTD4Q9Y4D8 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
HECTD4Q9Y4D8 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
HECTD4Q9Y4D8 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
HECTD4Q9Y4D8 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
HECTD4Q9Y4D8 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
HECTD4Q9Y4D8 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
HECTD4Q9Y4D8 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
HECTD4Q9Y4D8 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
HECTD4Q9Y4D8 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
HECTD4Q9Y4D8 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
HECTD4Q9Y4D8 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
HECTD4Q9Y4D8 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
HECTD4Q9Y4D8 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
HECTD4Q9Y4D8 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
HECTD4Q9Y4D8 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
HECTD4Q9Y4D8 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
HECTD4Q9Y4D8 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
HECTD4Q9Y4D8 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
HECTD4Q9Y4D8 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
HECTD4Q9Y4D8 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
HECTD4Q9Y4D8 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
HECTD4Q9Y4D8 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
HECTD4Q9Y4D8 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
HECTD4Q9Y4D8 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
HECTD4Q9Y4D8 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
HECTD4Q9Y4D8 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
HECTD4Q9Y4D8 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
HECTD4Q9Y4D8 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
HECTD4Q9Y4D8 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms