Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3L3

SH3BP1, SH3 domain-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1Q9Y3L3 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SH3BP1Q9Y3L3 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SH3BP1Q9Y3L3 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SH3BP1Q9Y3L3 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SH3BP1Q9Y3L3 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SH3BP1Q9Y3L3 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SH3BP1Q9Y3L3 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SH3BP1Q9Y3L3 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SH3BP1Q9Y3L3 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SH3BP1Q9Y3L3 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SH3BP1Q9Y3L3 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SH3BP1Q9Y3L3 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SH3BP1Q9Y3L3 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SH3BP1Q9Y3L3 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SH3BP1Q9Y3L3 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SH3BP1Q9Y3L3 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SH3BP1Q9Y3L3 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SH3BP1Q9Y3L3 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SH3BP1Q9Y3L3 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SH3BP1Q9Y3L3 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SH3BP1Q9Y3L3 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
SH3BP1Q9Y3L3 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
SH3BP1Q9Y3L3 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SH3BP1Q9Y3L3 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SH3BP1Q9Y3L3 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SH3BP1Q9Y3L3 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SH3BP1Q9Y3L3 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SH3BP1Q9Y3L3 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SH3BP1Q9Y3L3 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SH3BP1Q9Y3L3 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
SH3BP1Q9Y3L3 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SH3BP1Q9Y3L3 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SH3BP1Q9Y3L3 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SH3BP1Q9Y3L3 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SH3BP1Q9Y3L3 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SH3BP1Q9Y3L3 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SH3BP1Q9Y3L3 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SH3BP1Q9Y3L3 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
SH3BP1Q9Y3L3 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
SH3BP1Q9Y3L3 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
SH3BP1Q9Y3L3 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SH3BP1Q9Y3L3 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
SH3BP1Q9Y3L3 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SH3BP1Q9Y3L3 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SH3BP1Q9Y3L3 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SH3BP1Q9Y3L3 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
SH3BP1Q9Y3L3 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SH3BP1Q9Y3L3 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SH3BP1Q9Y3L3 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SH3BP1Q9Y3L3 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SH3BP1Q9Y3L3 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
SH3BP1Q9Y3L3 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SH3BP1Q9Y3L3 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SH3BP1Q9Y3L3 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SH3BP1Q9Y3L3 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SH3BP1Q9Y3L3 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SH3BP1Q9Y3L3 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SH3BP1Q9Y3L3 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SH3BP1Q9Y3L3 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SH3BP1Q9Y3L3 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SH3BP1Q9Y3L3 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
SH3BP1Q9Y3L3 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SH3BP1Q9Y3L3 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SH3BP1Q9Y3L3 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SH3BP1Q9Y3L3 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SH3BP1Q9Y3L3 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SH3BP1Q9Y3L3 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SH3BP1Q9Y3L3 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SH3BP1Q9Y3L3 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SH3BP1Q9Y3L3 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
SH3BP1Q9Y3L3 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SH3BP1Q9Y3L3 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SH3BP1Q9Y3L3 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SH3BP1Q9Y3L3 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SH3BP1Q9Y3L3 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SH3BP1Q9Y3L3 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SH3BP1Q9Y3L3 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SH3BP1Q9Y3L3 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SH3BP1Q9Y3L3 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SH3BP1Q9Y3L3 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SH3BP1Q9Y3L3 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SH3BP1Q9Y3L3 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SH3BP1Q9Y3L3 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SH3BP1Q9Y3L3 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SH3BP1Q9Y3L3 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SH3BP1Q9Y3L3 ZFHX2-205ENST00000615307 1972 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SH3BP1Q9Y3L3 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SH3BP1Q9Y3L3 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SH3BP1Q9Y3L3 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SH3BP1Q9Y3L3 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SH3BP1Q9Y3L3 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SH3BP1Q9Y3L3 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SH3BP1Q9Y3L3 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SH3BP1Q9Y3L3 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SH3BP1Q9Y3L3 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SH3BP1Q9Y3L3 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SH3BP1Q9Y3L3 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SH3BP1Q9Y3L3 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SH3BP1Q9Y3L3 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
SH3BP1Q9Y3L3 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms