Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y385

UBE2J1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 J1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2J1Q9Y385 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBE2J1Q9Y385 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
UBE2J1Q9Y385 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBE2J1Q9Y385 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBE2J1Q9Y385 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBE2J1Q9Y385 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBE2J1Q9Y385 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBE2J1Q9Y385 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBE2J1Q9Y385 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBE2J1Q9Y385 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBE2J1Q9Y385 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBE2J1Q9Y385 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBE2J1Q9Y385 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBE2J1Q9Y385 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBE2J1Q9Y385 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBE2J1Q9Y385 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBE2J1Q9Y385 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBE2J1Q9Y385 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBE2J1Q9Y385 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBE2J1Q9Y385 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBE2J1Q9Y385 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBE2J1Q9Y385 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBE2J1Q9Y385 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBE2J1Q9Y385 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBE2J1Q9Y385 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBE2J1Q9Y385 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBE2J1Q9Y385 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBE2J1Q9Y385 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBE2J1Q9Y385 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBE2J1Q9Y385 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBE2J1Q9Y385 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBE2J1Q9Y385 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBE2J1Q9Y385 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBE2J1Q9Y385 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBE2J1Q9Y385 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBE2J1Q9Y385 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBE2J1Q9Y385 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBE2J1Q9Y385 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBE2J1Q9Y385 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
UBE2J1Q9Y385 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBE2J1Q9Y385 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBE2J1Q9Y385 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBE2J1Q9Y385 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBE2J1Q9Y385 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBE2J1Q9Y385 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBE2J1Q9Y385 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBE2J1Q9Y385 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
UBE2J1Q9Y385 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBE2J1Q9Y385 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBE2J1Q9Y385 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
UBE2J1Q9Y385 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBE2J1Q9Y385 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBE2J1Q9Y385 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
UBE2J1Q9Y385 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBE2J1Q9Y385 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBE2J1Q9Y385 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBE2J1Q9Y385 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBE2J1Q9Y385 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBE2J1Q9Y385 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBE2J1Q9Y385 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBE2J1Q9Y385 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBE2J1Q9Y385 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBE2J1Q9Y385 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBE2J1Q9Y385 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBE2J1Q9Y385 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBE2J1Q9Y385 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBE2J1Q9Y385 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBE2J1Q9Y385 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBE2J1Q9Y385 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBE2J1Q9Y385 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBE2J1Q9Y385 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBE2J1Q9Y385 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBE2J1Q9Y385 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBE2J1Q9Y385 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
UBE2J1Q9Y385 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBE2J1Q9Y385 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBE2J1Q9Y385 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBE2J1Q9Y385 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBE2J1Q9Y385 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBE2J1Q9Y385 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBE2J1Q9Y385 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBE2J1Q9Y385 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBE2J1Q9Y385 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBE2J1Q9Y385 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBE2J1Q9Y385 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBE2J1Q9Y385 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBE2J1Q9Y385 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBE2J1Q9Y385 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBE2J1Q9Y385 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBE2J1Q9Y385 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBE2J1Q9Y385 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
UBE2J1Q9Y385 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBE2J1Q9Y385 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBE2J1Q9Y385 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBE2J1Q9Y385 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBE2J1Q9Y385 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
UBE2J1Q9Y385 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBE2J1Q9Y385 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBE2J1Q9Y385 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBE2J1Q9Y385 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms