Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y266

NUDC, Nuclear migration protein nudC, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUDCQ9Y266 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NUDCQ9Y266 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NUDCQ9Y266 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NUDCQ9Y266 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NUDCQ9Y266 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NUDCQ9Y266 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NUDCQ9Y266 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NUDCQ9Y266 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NUDCQ9Y266 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
NUDCQ9Y266 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NUDCQ9Y266 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
NUDCQ9Y266 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NUDCQ9Y266 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NUDCQ9Y266 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NUDCQ9Y266 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NUDCQ9Y266 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NUDCQ9Y266 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NUDCQ9Y266 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NUDCQ9Y266 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NUDCQ9Y266 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NUDCQ9Y266 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NUDCQ9Y266 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NUDCQ9Y266 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NUDCQ9Y266 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NUDCQ9Y266 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NUDCQ9Y266 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NUDCQ9Y266 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NUDCQ9Y266 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NUDCQ9Y266 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NUDCQ9Y266 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NUDCQ9Y266 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NUDCQ9Y266 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NUDCQ9Y266 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NUDCQ9Y266 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NUDCQ9Y266 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NUDCQ9Y266 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NUDCQ9Y266 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NUDCQ9Y266 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NUDCQ9Y266 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NUDCQ9Y266 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NUDCQ9Y266 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NUDCQ9Y266 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NUDCQ9Y266 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
NUDCQ9Y266 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NUDCQ9Y266 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NUDCQ9Y266 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NUDCQ9Y266 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NUDCQ9Y266 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NUDCQ9Y266 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NUDCQ9Y266 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NUDCQ9Y266 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NUDCQ9Y266 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NUDCQ9Y266 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NUDCQ9Y266 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NUDCQ9Y266 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NUDCQ9Y266 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NUDCQ9Y266 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NUDCQ9Y266 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NUDCQ9Y266 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NUDCQ9Y266 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NUDCQ9Y266 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NUDCQ9Y266 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NUDCQ9Y266 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
NUDCQ9Y266 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NUDCQ9Y266 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
NUDCQ9Y266 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
NUDCQ9Y266 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NUDCQ9Y266 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
NUDCQ9Y266 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NUDCQ9Y266 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
NUDCQ9Y266 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NUDCQ9Y266 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NUDCQ9Y266 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NUDCQ9Y266 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NUDCQ9Y266 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NUDCQ9Y266 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NUDCQ9Y266 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NUDCQ9Y266 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
NUDCQ9Y266 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NUDCQ9Y266 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NUDCQ9Y266 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NUDCQ9Y266 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NUDCQ9Y266 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NUDCQ9Y266 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NUDCQ9Y266 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NUDCQ9Y266 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NUDCQ9Y266 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NUDCQ9Y266 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NUDCQ9Y266 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NUDCQ9Y266 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NUDCQ9Y266 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NUDCQ9Y266 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NUDCQ9Y266 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NUDCQ9Y266 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NUDCQ9Y266 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NUDCQ9Y266 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
NUDCQ9Y266 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NUDCQ9Y266 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NUDCQ9Y266 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NUDCQ9Y266 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms