Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNS2

COPS3, COP9 signalosome complex subunit 3, humanhuman

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Length 423 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS3Q9UNS2 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
COPS3Q9UNS2 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
COPS3Q9UNS2 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
COPS3Q9UNS2 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
COPS3Q9UNS2 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
COPS3Q9UNS2 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
COPS3Q9UNS2 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
COPS3Q9UNS2 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
COPS3Q9UNS2 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
COPS3Q9UNS2 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
COPS3Q9UNS2 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
COPS3Q9UNS2 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
COPS3Q9UNS2 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
COPS3Q9UNS2 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
COPS3Q9UNS2 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
COPS3Q9UNS2 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
COPS3Q9UNS2 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
COPS3Q9UNS2 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
COPS3Q9UNS2 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
COPS3Q9UNS2 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
COPS3Q9UNS2 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
COPS3Q9UNS2 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
COPS3Q9UNS2 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
COPS3Q9UNS2 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
COPS3Q9UNS2 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
COPS3Q9UNS2 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
COPS3Q9UNS2 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
COPS3Q9UNS2 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
COPS3Q9UNS2 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
COPS3Q9UNS2 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
COPS3Q9UNS2 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
COPS3Q9UNS2 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
COPS3Q9UNS2 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
COPS3Q9UNS2 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
COPS3Q9UNS2 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
COPS3Q9UNS2 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
COPS3Q9UNS2 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
COPS3Q9UNS2 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
COPS3Q9UNS2 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
COPS3Q9UNS2 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
COPS3Q9UNS2 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
COPS3Q9UNS2 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
COPS3Q9UNS2 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
COPS3Q9UNS2 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
COPS3Q9UNS2 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
COPS3Q9UNS2 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
COPS3Q9UNS2 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
COPS3Q9UNS2 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
COPS3Q9UNS2 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
COPS3Q9UNS2 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
COPS3Q9UNS2 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
COPS3Q9UNS2 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
COPS3Q9UNS2 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
COPS3Q9UNS2 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
COPS3Q9UNS2 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
COPS3Q9UNS2 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
COPS3Q9UNS2 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
COPS3Q9UNS2 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
COPS3Q9UNS2 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
COPS3Q9UNS2 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
COPS3Q9UNS2 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
COPS3Q9UNS2 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
COPS3Q9UNS2 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
COPS3Q9UNS2 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
COPS3Q9UNS2 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
COPS3Q9UNS2 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
COPS3Q9UNS2 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
COPS3Q9UNS2 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
COPS3Q9UNS2 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
COPS3Q9UNS2 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
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COPS3Q9UNS2 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
COPS3Q9UNS2 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
COPS3Q9UNS2 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
COPS3Q9UNS2 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
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COPS3Q9UNS2 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
COPS3Q9UNS2 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
COPS3Q9UNS2 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
COPS3Q9UNS2 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
COPS3Q9UNS2 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
COPS3Q9UNS2 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
COPS3Q9UNS2 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
COPS3Q9UNS2 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
COPS3Q9UNS2 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
COPS3Q9UNS2 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
COPS3Q9UNS2 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
COPS3Q9UNS2 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
COPS3Q9UNS2 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
COPS3Q9UNS2 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
COPS3Q9UNS2 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
COPS3Q9UNS2 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
COPS3Q9UNS2 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
COPS3Q9UNS2 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
COPS3Q9UNS2 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
COPS3Q9UNS2 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
COPS3Q9UNS2 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
COPS3Q9UNS2 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
COPS3Q9UNS2 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
COPS3Q9UNS2 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
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