Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMY4

SNX12, Sorting nexin-12, humanhuman

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX12Q9UMY4 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SNX12Q9UMY4 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SNX12Q9UMY4 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SNX12Q9UMY4 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SNX12Q9UMY4 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SNX12Q9UMY4 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SNX12Q9UMY4 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SNX12Q9UMY4 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SNX12Q9UMY4 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SNX12Q9UMY4 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SNX12Q9UMY4 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SNX12Q9UMY4 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SNX12Q9UMY4 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SNX12Q9UMY4 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SNX12Q9UMY4 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SNX12Q9UMY4 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SNX12Q9UMY4 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SNX12Q9UMY4 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SNX12Q9UMY4 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SNX12Q9UMY4 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SNX12Q9UMY4 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SNX12Q9UMY4 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SNX12Q9UMY4 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SNX12Q9UMY4 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SNX12Q9UMY4 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SNX12Q9UMY4 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SNX12Q9UMY4 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SNX12Q9UMY4 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SNX12Q9UMY4 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SNX12Q9UMY4 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SNX12Q9UMY4 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SNX12Q9UMY4 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SNX12Q9UMY4 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SNX12Q9UMY4 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SNX12Q9UMY4 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SNX12Q9UMY4 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SNX12Q9UMY4 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SNX12Q9UMY4 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SNX12Q9UMY4 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SNX12Q9UMY4 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SNX12Q9UMY4 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SNX12Q9UMY4 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SNX12Q9UMY4 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SNX12Q9UMY4 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SNX12Q9UMY4 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SNX12Q9UMY4 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SNX12Q9UMY4 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SNX12Q9UMY4 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
SNX12Q9UMY4 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SNX12Q9UMY4 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SNX12Q9UMY4 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SNX12Q9UMY4 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SNX12Q9UMY4 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SNX12Q9UMY4 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SNX12Q9UMY4 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SNX12Q9UMY4 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SNX12Q9UMY4 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SNX12Q9UMY4 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SNX12Q9UMY4 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SNX12Q9UMY4 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SNX12Q9UMY4 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SNX12Q9UMY4 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SNX12Q9UMY4 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SNX12Q9UMY4 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
SNX12Q9UMY4 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SNX12Q9UMY4 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SNX12Q9UMY4 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SNX12Q9UMY4 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SNX12Q9UMY4 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SNX12Q9UMY4 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SNX12Q9UMY4 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SNX12Q9UMY4 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SNX12Q9UMY4 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SNX12Q9UMY4 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SNX12Q9UMY4 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SNX12Q9UMY4 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SNX12Q9UMY4 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SNX12Q9UMY4 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SNX12Q9UMY4 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SNX12Q9UMY4 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SNX12Q9UMY4 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SNX12Q9UMY4 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SNX12Q9UMY4 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SNX12Q9UMY4 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SNX12Q9UMY4 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SNX12Q9UMY4 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SNX12Q9UMY4 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SNX12Q9UMY4 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SNX12Q9UMY4 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SNX12Q9UMY4 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SNX12Q9UMY4 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SNX12Q9UMY4 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SNX12Q9UMY4 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SNX12Q9UMY4 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SNX12Q9UMY4 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SNX12Q9UMY4 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SNX12Q9UMY4 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SNX12Q9UMY4 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SNX12Q9UMY4 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SNX12Q9UMY4 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms