Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULT0

TTC7A, Tetratricopeptide repeat protein 7A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 858 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC7AQ9ULT0 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TTC7AQ9ULT0 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TTC7AQ9ULT0 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TTC7AQ9ULT0 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TTC7AQ9ULT0 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TTC7AQ9ULT0 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TTC7AQ9ULT0 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TTC7AQ9ULT0 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TTC7AQ9ULT0 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TTC7AQ9ULT0 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TTC7AQ9ULT0 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TTC7AQ9ULT0 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TTC7AQ9ULT0 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TTC7AQ9ULT0 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TTC7AQ9ULT0 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TTC7AQ9ULT0 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TTC7AQ9ULT0 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TTC7AQ9ULT0 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TTC7AQ9ULT0 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TTC7AQ9ULT0 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TTC7AQ9ULT0 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TTC7AQ9ULT0 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TTC7AQ9ULT0 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TTC7AQ9ULT0 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TTC7AQ9ULT0 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TTC7AQ9ULT0 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TTC7AQ9ULT0 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TTC7AQ9ULT0 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TTC7AQ9ULT0 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TTC7AQ9ULT0 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TTC7AQ9ULT0 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TTC7AQ9ULT0 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TTC7AQ9ULT0 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TTC7AQ9ULT0 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TTC7AQ9ULT0 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TTC7AQ9ULT0 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TTC7AQ9ULT0 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TTC7AQ9ULT0 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TTC7AQ9ULT0 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TTC7AQ9ULT0 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TTC7AQ9ULT0 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TTC7AQ9ULT0 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TTC7AQ9ULT0 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TTC7AQ9ULT0 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TTC7AQ9ULT0 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TTC7AQ9ULT0 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TTC7AQ9ULT0 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TTC7AQ9ULT0 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TTC7AQ9ULT0 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TTC7AQ9ULT0 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TTC7AQ9ULT0 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TTC7AQ9ULT0 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TTC7AQ9ULT0 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
TTC7AQ9ULT0 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TTC7AQ9ULT0 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TTC7AQ9ULT0 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
TTC7AQ9ULT0 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TTC7AQ9ULT0 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TTC7AQ9ULT0 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TTC7AQ9ULT0 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TTC7AQ9ULT0 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
TTC7AQ9ULT0 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
TTC7AQ9ULT0 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TTC7AQ9ULT0 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TTC7AQ9ULT0 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TTC7AQ9ULT0 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TTC7AQ9ULT0 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TTC7AQ9ULT0 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TTC7AQ9ULT0 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TTC7AQ9ULT0 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TTC7AQ9ULT0 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TTC7AQ9ULT0 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TTC7AQ9ULT0 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TTC7AQ9ULT0 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TTC7AQ9ULT0 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TTC7AQ9ULT0 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TTC7AQ9ULT0 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TTC7AQ9ULT0 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TTC7AQ9ULT0 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TTC7AQ9ULT0 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TTC7AQ9ULT0 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TTC7AQ9ULT0 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TTC7AQ9ULT0 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TTC7AQ9ULT0 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TTC7AQ9ULT0 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TTC7AQ9ULT0 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TTC7AQ9ULT0 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TTC7AQ9ULT0 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TTC7AQ9ULT0 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TTC7AQ9ULT0 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TTC7AQ9ULT0 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TTC7AQ9ULT0 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TTC7AQ9ULT0 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
TTC7AQ9ULT0 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TTC7AQ9ULT0 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TTC7AQ9ULT0 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TTC7AQ9ULT0 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
TTC7AQ9ULT0 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
TTC7AQ9ULT0 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TTC7AQ9ULT0 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
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