Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL33

TRAPPC2L, Trafficking protein particle complex subunit 2-like protein, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC2LQ9UL33 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
TRAPPC2LQ9UL33 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TRAPPC2LQ9UL33 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TRAPPC2LQ9UL33 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TRAPPC2LQ9UL33 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TRAPPC2LQ9UL33 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TRAPPC2LQ9UL33 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
TRAPPC2LQ9UL33 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
TRAPPC2LQ9UL33 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TRAPPC2LQ9UL33 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TRAPPC2LQ9UL33 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TRAPPC2LQ9UL33 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TRAPPC2LQ9UL33 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
TRAPPC2LQ9UL33 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
TRAPPC2LQ9UL33 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
TRAPPC2LQ9UL33 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC15.02■□□□□ -0
TRAPPC2LQ9UL33 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
TRAPPC2LQ9UL33 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
TRAPPC2LQ9UL33 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
TRAPPC2LQ9UL33 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
TRAPPC2LQ9UL33 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
TRAPPC2LQ9UL33 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
TRAPPC2LQ9UL33 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
TRAPPC2LQ9UL33 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
TRAPPC2LQ9UL33 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
TRAPPC2LQ9UL33 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
TRAPPC2LQ9UL33 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
TRAPPC2LQ9UL33 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
TRAPPC2LQ9UL33 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
TRAPPC2LQ9UL33 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
TRAPPC2LQ9UL33 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
TRAPPC2LQ9UL33 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
TRAPPC2LQ9UL33 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
TRAPPC2LQ9UL33 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
TRAPPC2LQ9UL33 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
TRAPPC2LQ9UL33 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
TRAPPC2LQ9UL33 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
TRAPPC2LQ9UL33 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
TRAPPC2LQ9UL33 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.02□□□□□ -0.01
TRAPPC2LQ9UL33 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
TRAPPC2LQ9UL33 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC15.02□□□□□ -0.01
TRAPPC2LQ9UL33 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TRAPPC2LQ9UL33 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TRAPPC2LQ9UL33 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TRAPPC2LQ9UL33 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TRAPPC2LQ9UL33 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TRAPPC2LQ9UL33 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TRAPPC2LQ9UL33 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TRAPPC2LQ9UL33 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TRAPPC2LQ9UL33 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TRAPPC2LQ9UL33 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TRAPPC2LQ9UL33 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TRAPPC2LQ9UL33 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TRAPPC2LQ9UL33 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TRAPPC2LQ9UL33 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TRAPPC2LQ9UL33 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TRAPPC2LQ9UL33 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TRAPPC2LQ9UL33 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TRAPPC2LQ9UL33 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TRAPPC2LQ9UL33 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TRAPPC2LQ9UL33 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TRAPPC2LQ9UL33 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TRAPPC2LQ9UL33 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TRAPPC2LQ9UL33 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TRAPPC2LQ9UL33 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TRAPPC2LQ9UL33 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
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TRAPPC2LQ9UL33 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TRAPPC2LQ9UL33 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TRAPPC2LQ9UL33 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TRAPPC2LQ9UL33 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TRAPPC2LQ9UL33 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TRAPPC2LQ9UL33 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TRAPPC2LQ9UL33 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TRAPPC2LQ9UL33 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TRAPPC2LQ9UL33 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TRAPPC2LQ9UL33 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TRAPPC2LQ9UL33 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
TRAPPC2LQ9UL33 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TRAPPC2LQ9UL33 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TRAPPC2LQ9UL33 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
TRAPPC2LQ9UL33 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TRAPPC2LQ9UL33 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
TRAPPC2LQ9UL33 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
TRAPPC2LQ9UL33 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
TRAPPC2LQ9UL33 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
TRAPPC2LQ9UL33 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TRAPPC2LQ9UL33 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TRAPPC2LQ9UL33 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TRAPPC2LQ9UL33 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TRAPPC2LQ9UL33 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TRAPPC2LQ9UL33 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TRAPPC2LQ9UL33 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
TRAPPC2LQ9UL33 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
TRAPPC2LQ9UL33 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
TRAPPC2LQ9UL33 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC15□□□□□ -0.01
TRAPPC2LQ9UL33 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
TRAPPC2LQ9UL33 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC15□□□□□ -0.01
TRAPPC2LQ9UL33 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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