Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKV0

HDAC9, Histone deacetylase 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,011 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC9Q9UKV0 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HDAC9Q9UKV0 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HDAC9Q9UKV0 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HDAC9Q9UKV0 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HDAC9Q9UKV0 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HDAC9Q9UKV0 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
HDAC9Q9UKV0 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
HDAC9Q9UKV0 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HDAC9Q9UKV0 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HDAC9Q9UKV0 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HDAC9Q9UKV0 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HDAC9Q9UKV0 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HDAC9Q9UKV0 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HDAC9Q9UKV0 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HDAC9Q9UKV0 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HDAC9Q9UKV0 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HDAC9Q9UKV0 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
HDAC9Q9UKV0 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HDAC9Q9UKV0 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
HDAC9Q9UKV0 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
HDAC9Q9UKV0 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
HDAC9Q9UKV0 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
HDAC9Q9UKV0 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HDAC9Q9UKV0 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
HDAC9Q9UKV0 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HDAC9Q9UKV0 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
HDAC9Q9UKV0 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
HDAC9Q9UKV0 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HDAC9Q9UKV0 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
HDAC9Q9UKV0 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HDAC9Q9UKV0 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
HDAC9Q9UKV0 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
HDAC9Q9UKV0 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HDAC9Q9UKV0 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
HDAC9Q9UKV0 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HDAC9Q9UKV0 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HDAC9Q9UKV0 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HDAC9Q9UKV0 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
HDAC9Q9UKV0 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HDAC9Q9UKV0 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HDAC9Q9UKV0 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HDAC9Q9UKV0 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HDAC9Q9UKV0 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HDAC9Q9UKV0 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
HDAC9Q9UKV0 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HDAC9Q9UKV0 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HDAC9Q9UKV0 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HDAC9Q9UKV0 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HDAC9Q9UKV0 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HDAC9Q9UKV0 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HDAC9Q9UKV0 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HDAC9Q9UKV0 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HDAC9Q9UKV0 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HDAC9Q9UKV0 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HDAC9Q9UKV0 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HDAC9Q9UKV0 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
HDAC9Q9UKV0 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HDAC9Q9UKV0 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HDAC9Q9UKV0 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HDAC9Q9UKV0 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HDAC9Q9UKV0 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HDAC9Q9UKV0 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HDAC9Q9UKV0 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
HDAC9Q9UKV0 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HDAC9Q9UKV0 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HDAC9Q9UKV0 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HDAC9Q9UKV0 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HDAC9Q9UKV0 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
HDAC9Q9UKV0 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HDAC9Q9UKV0 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
HDAC9Q9UKV0 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
HDAC9Q9UKV0 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
HDAC9Q9UKV0 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
HDAC9Q9UKV0 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
HDAC9Q9UKV0 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HDAC9Q9UKV0 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
HDAC9Q9UKV0 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
HDAC9Q9UKV0 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
HDAC9Q9UKV0 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
HDAC9Q9UKV0 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
HDAC9Q9UKV0 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
HDAC9Q9UKV0 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HDAC9Q9UKV0 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HDAC9Q9UKV0 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
HDAC9Q9UKV0 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HDAC9Q9UKV0 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
HDAC9Q9UKV0 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HDAC9Q9UKV0 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HDAC9Q9UKV0 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
HDAC9Q9UKV0 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
HDAC9Q9UKV0 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HDAC9Q9UKV0 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HDAC9Q9UKV0 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
HDAC9Q9UKV0 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HDAC9Q9UKV0 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
HDAC9Q9UKV0 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
HDAC9Q9UKV0 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HDAC9Q9UKV0 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HDAC9Q9UKV0 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
HDAC9Q9UKV0 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms