Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJJ7

RPUSD1, RNA pseudouridylate synthase domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 312 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPUSD1Q9UJJ7 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
RPUSD1Q9UJJ7 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
RPUSD1Q9UJJ7 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RPUSD1Q9UJJ7 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
RPUSD1Q9UJJ7 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
RPUSD1Q9UJJ7 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
RPUSD1Q9UJJ7 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RPUSD1Q9UJJ7 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RPUSD1Q9UJJ7 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
RPUSD1Q9UJJ7 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
RPUSD1Q9UJJ7 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
RPUSD1Q9UJJ7 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RPUSD1Q9UJJ7 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
RPUSD1Q9UJJ7 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
RPUSD1Q9UJJ7 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
RPUSD1Q9UJJ7 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
RPUSD1Q9UJJ7 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RPUSD1Q9UJJ7 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RPUSD1Q9UJJ7 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
RPUSD1Q9UJJ7 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RPUSD1Q9UJJ7 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
RPUSD1Q9UJJ7 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
RPUSD1Q9UJJ7 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
RPUSD1Q9UJJ7 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
RPUSD1Q9UJJ7 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
RPUSD1Q9UJJ7 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
RPUSD1Q9UJJ7 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
RPUSD1Q9UJJ7 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
RPUSD1Q9UJJ7 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
RPUSD1Q9UJJ7 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
RPUSD1Q9UJJ7 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
RPUSD1Q9UJJ7 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
RPUSD1Q9UJJ7 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
RPUSD1Q9UJJ7 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
RPUSD1Q9UJJ7 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
RPUSD1Q9UJJ7 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
RPUSD1Q9UJJ7 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
RPUSD1Q9UJJ7 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
RPUSD1Q9UJJ7 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
RPUSD1Q9UJJ7 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
RPUSD1Q9UJJ7 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
RPUSD1Q9UJJ7 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
RPUSD1Q9UJJ7 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
RPUSD1Q9UJJ7 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
RPUSD1Q9UJJ7 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
RPUSD1Q9UJJ7 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
RPUSD1Q9UJJ7 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
RPUSD1Q9UJJ7 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
RPUSD1Q9UJJ7 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
RPUSD1Q9UJJ7 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
RPUSD1Q9UJJ7 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC14.79□□□□□ -0.04
RPUSD1Q9UJJ7 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
RPUSD1Q9UJJ7 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
RPUSD1Q9UJJ7 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
RPUSD1Q9UJJ7 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RPUSD1Q9UJJ7 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RPUSD1Q9UJJ7 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RPUSD1Q9UJJ7 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RPUSD1Q9UJJ7 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RPUSD1Q9UJJ7 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
RPUSD1Q9UJJ7 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RPUSD1Q9UJJ7 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
RPUSD1Q9UJJ7 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RPUSD1Q9UJJ7 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RPUSD1Q9UJJ7 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RPUSD1Q9UJJ7 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
RPUSD1Q9UJJ7 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
RPUSD1Q9UJJ7 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RPUSD1Q9UJJ7 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
RPUSD1Q9UJJ7 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RPUSD1Q9UJJ7 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RPUSD1Q9UJJ7 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
RPUSD1Q9UJJ7 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
RPUSD1Q9UJJ7 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
RPUSD1Q9UJJ7 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RPUSD1Q9UJJ7 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RPUSD1Q9UJJ7 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
RPUSD1Q9UJJ7 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RPUSD1Q9UJJ7 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RPUSD1Q9UJJ7 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
RPUSD1Q9UJJ7 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RPUSD1Q9UJJ7 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
RPUSD1Q9UJJ7 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
RPUSD1Q9UJJ7 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
RPUSD1Q9UJJ7 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
RPUSD1Q9UJJ7 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
RPUSD1Q9UJJ7 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
RPUSD1Q9UJJ7 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
RPUSD1Q9UJJ7 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RPUSD1Q9UJJ7 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RPUSD1Q9UJJ7 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
RPUSD1Q9UJJ7 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RPUSD1Q9UJJ7 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RPUSD1Q9UJJ7 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
RPUSD1Q9UJJ7 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
RPUSD1Q9UJJ7 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
RPUSD1Q9UJJ7 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
RPUSD1Q9UJJ7 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RPUSD1Q9UJJ7 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
RPUSD1Q9UJJ7 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
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