Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHC9

NPC1L1, Niemann-Pick C1-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPC1L1Q9UHC9 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NPC1L1Q9UHC9 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NPC1L1Q9UHC9 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
NPC1L1Q9UHC9 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NPC1L1Q9UHC9 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NPC1L1Q9UHC9 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NPC1L1Q9UHC9 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
NPC1L1Q9UHC9 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NPC1L1Q9UHC9 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NPC1L1Q9UHC9 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NPC1L1Q9UHC9 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NPC1L1Q9UHC9 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NPC1L1Q9UHC9 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NPC1L1Q9UHC9 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NPC1L1Q9UHC9 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NPC1L1Q9UHC9 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NPC1L1Q9UHC9 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
NPC1L1Q9UHC9 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NPC1L1Q9UHC9 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NPC1L1Q9UHC9 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NPC1L1Q9UHC9 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NPC1L1Q9UHC9 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NPC1L1Q9UHC9 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NPC1L1Q9UHC9 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NPC1L1Q9UHC9 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NPC1L1Q9UHC9 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NPC1L1Q9UHC9 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
NPC1L1Q9UHC9 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NPC1L1Q9UHC9 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NPC1L1Q9UHC9 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NPC1L1Q9UHC9 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
NPC1L1Q9UHC9 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
NPC1L1Q9UHC9 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NPC1L1Q9UHC9 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NPC1L1Q9UHC9 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NPC1L1Q9UHC9 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NPC1L1Q9UHC9 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NPC1L1Q9UHC9 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NPC1L1Q9UHC9 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NPC1L1Q9UHC9 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NPC1L1Q9UHC9 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NPC1L1Q9UHC9 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NPC1L1Q9UHC9 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NPC1L1Q9UHC9 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NPC1L1Q9UHC9 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NPC1L1Q9UHC9 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NPC1L1Q9UHC9 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NPC1L1Q9UHC9 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NPC1L1Q9UHC9 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NPC1L1Q9UHC9 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NPC1L1Q9UHC9 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NPC1L1Q9UHC9 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NPC1L1Q9UHC9 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NPC1L1Q9UHC9 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NPC1L1Q9UHC9 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NPC1L1Q9UHC9 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NPC1L1Q9UHC9 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NPC1L1Q9UHC9 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NPC1L1Q9UHC9 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NPC1L1Q9UHC9 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NPC1L1Q9UHC9 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NPC1L1Q9UHC9 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NPC1L1Q9UHC9 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NPC1L1Q9UHC9 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NPC1L1Q9UHC9 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NPC1L1Q9UHC9 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NPC1L1Q9UHC9 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NPC1L1Q9UHC9 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NPC1L1Q9UHC9 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NPC1L1Q9UHC9 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NPC1L1Q9UHC9 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NPC1L1Q9UHC9 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NPC1L1Q9UHC9 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NPC1L1Q9UHC9 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NPC1L1Q9UHC9 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NPC1L1Q9UHC9 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
NPC1L1Q9UHC9 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
NPC1L1Q9UHC9 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NPC1L1Q9UHC9 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NPC1L1Q9UHC9 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NPC1L1Q9UHC9 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NPC1L1Q9UHC9 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NPC1L1Q9UHC9 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NPC1L1Q9UHC9 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
NPC1L1Q9UHC9 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
NPC1L1Q9UHC9 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
NPC1L1Q9UHC9 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
NPC1L1Q9UHC9 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
NPC1L1Q9UHC9 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
NPC1L1Q9UHC9 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
NPC1L1Q9UHC9 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
NPC1L1Q9UHC9 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
NPC1L1Q9UHC9 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
NPC1L1Q9UHC9 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
NPC1L1Q9UHC9 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
NPC1L1Q9UHC9 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
NPC1L1Q9UHC9 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC23.83■■□□□ 1.41
NPC1L1Q9UHC9 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
NPC1L1Q9UHC9 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
NPC1L1Q9UHC9 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms