Protein–RNA interactions for Protein: Q9UH90

FBXO40, F-box only protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO40Q9UH90 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
FBXO40Q9UH90 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
FBXO40Q9UH90 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
FBXO40Q9UH90 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
FBXO40Q9UH90 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
FBXO40Q9UH90 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
FBXO40Q9UH90 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
FBXO40Q9UH90 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FBXO40Q9UH90 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
FBXO40Q9UH90 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
FBXO40Q9UH90 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FBXO40Q9UH90 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FBXO40Q9UH90 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FBXO40Q9UH90 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FBXO40Q9UH90 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FBXO40Q9UH90 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FBXO40Q9UH90 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
FBXO40Q9UH90 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FBXO40Q9UH90 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FBXO40Q9UH90 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
FBXO40Q9UH90 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
FBXO40Q9UH90 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
FBXO40Q9UH90 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FBXO40Q9UH90 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
FBXO40Q9UH90 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
FBXO40Q9UH90 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FBXO40Q9UH90 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FBXO40Q9UH90 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FBXO40Q9UH90 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FBXO40Q9UH90 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FBXO40Q9UH90 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FBXO40Q9UH90 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
FBXO40Q9UH90 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FBXO40Q9UH90 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FBXO40Q9UH90 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
FBXO40Q9UH90 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
FBXO40Q9UH90 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
FBXO40Q9UH90 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
FBXO40Q9UH90 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
FBXO40Q9UH90 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
FBXO40Q9UH90 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
FBXO40Q9UH90 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
FBXO40Q9UH90 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
FBXO40Q9UH90 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
FBXO40Q9UH90 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
FBXO40Q9UH90 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
FBXO40Q9UH90 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
FBXO40Q9UH90 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
FBXO40Q9UH90 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
FBXO40Q9UH90 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
FBXO40Q9UH90 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
FBXO40Q9UH90 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
FBXO40Q9UH90 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
FBXO40Q9UH90 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
FBXO40Q9UH90 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
FBXO40Q9UH90 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
FBXO40Q9UH90 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
FBXO40Q9UH90 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
FBXO40Q9UH90 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
FBXO40Q9UH90 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
FBXO40Q9UH90 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
FBXO40Q9UH90 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
FBXO40Q9UH90 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
FBXO40Q9UH90 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
FBXO40Q9UH90 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
FBXO40Q9UH90 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
FBXO40Q9UH90 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
FBXO40Q9UH90 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
FBXO40Q9UH90 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
FBXO40Q9UH90 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
FBXO40Q9UH90 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC20.14■□□□□ 0.82
FBXO40Q9UH90 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
FBXO40Q9UH90 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
FBXO40Q9UH90 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
FBXO40Q9UH90 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
FBXO40Q9UH90 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
FBXO40Q9UH90 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
FBXO40Q9UH90 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
FBXO40Q9UH90 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
FBXO40Q9UH90 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
FBXO40Q9UH90 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
FBXO40Q9UH90 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
FBXO40Q9UH90 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
FBXO40Q9UH90 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
FBXO40Q9UH90 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
FBXO40Q9UH90 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
FBXO40Q9UH90 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
FBXO40Q9UH90 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
FBXO40Q9UH90 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
FBXO40Q9UH90 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
FBXO40Q9UH90 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
FBXO40Q9UH90 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
FBXO40Q9UH90 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
FBXO40Q9UH90 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
FBXO40Q9UH90 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
FBXO40Q9UH90 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
FBXO40Q9UH90 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
FBXO40Q9UH90 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FBXO40Q9UH90 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FBXO40Q9UH90 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.5 ms