Protein–RNA interactions for Protein: Q9UDT6

CLIP2, CAP-Gly domain-containing linker protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,046 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP2Q9UDT6 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CLIP2Q9UDT6 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CLIP2Q9UDT6 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CLIP2Q9UDT6 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CLIP2Q9UDT6 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CLIP2Q9UDT6 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CLIP2Q9UDT6 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CLIP2Q9UDT6 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CLIP2Q9UDT6 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CLIP2Q9UDT6 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CLIP2Q9UDT6 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CLIP2Q9UDT6 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CLIP2Q9UDT6 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CLIP2Q9UDT6 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CLIP2Q9UDT6 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CLIP2Q9UDT6 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CLIP2Q9UDT6 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CLIP2Q9UDT6 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CLIP2Q9UDT6 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CLIP2Q9UDT6 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CLIP2Q9UDT6 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CLIP2Q9UDT6 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CLIP2Q9UDT6 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CLIP2Q9UDT6 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CLIP2Q9UDT6 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CLIP2Q9UDT6 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CLIP2Q9UDT6 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CLIP2Q9UDT6 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CLIP2Q9UDT6 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CLIP2Q9UDT6 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CLIP2Q9UDT6 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CLIP2Q9UDT6 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CLIP2Q9UDT6 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CLIP2Q9UDT6 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CLIP2Q9UDT6 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CLIP2Q9UDT6 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CLIP2Q9UDT6 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CLIP2Q9UDT6 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CLIP2Q9UDT6 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CLIP2Q9UDT6 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CLIP2Q9UDT6 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CLIP2Q9UDT6 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CLIP2Q9UDT6 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CLIP2Q9UDT6 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CLIP2Q9UDT6 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CLIP2Q9UDT6 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CLIP2Q9UDT6 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
CLIP2Q9UDT6 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CLIP2Q9UDT6 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
CLIP2Q9UDT6 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CLIP2Q9UDT6 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CLIP2Q9UDT6 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CLIP2Q9UDT6 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
CLIP2Q9UDT6 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
CLIP2Q9UDT6 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CLIP2Q9UDT6 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CLIP2Q9UDT6 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CLIP2Q9UDT6 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CLIP2Q9UDT6 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CLIP2Q9UDT6 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CLIP2Q9UDT6 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CLIP2Q9UDT6 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CLIP2Q9UDT6 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CLIP2Q9UDT6 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CLIP2Q9UDT6 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CLIP2Q9UDT6 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CLIP2Q9UDT6 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CLIP2Q9UDT6 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CLIP2Q9UDT6 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CLIP2Q9UDT6 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CLIP2Q9UDT6 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CLIP2Q9UDT6 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CLIP2Q9UDT6 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CLIP2Q9UDT6 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CLIP2Q9UDT6 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CLIP2Q9UDT6 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CLIP2Q9UDT6 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CLIP2Q9UDT6 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CLIP2Q9UDT6 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CLIP2Q9UDT6 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CLIP2Q9UDT6 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CLIP2Q9UDT6 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CLIP2Q9UDT6 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
CLIP2Q9UDT6 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
CLIP2Q9UDT6 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CLIP2Q9UDT6 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
CLIP2Q9UDT6 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CLIP2Q9UDT6 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CLIP2Q9UDT6 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CLIP2Q9UDT6 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
CLIP2Q9UDT6 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
CLIP2Q9UDT6 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CLIP2Q9UDT6 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
CLIP2Q9UDT6 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CLIP2Q9UDT6 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CLIP2Q9UDT6 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
CLIP2Q9UDT6 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CLIP2Q9UDT6 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CLIP2Q9UDT6 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
CLIP2Q9UDT6 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms