Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBZ4

APEX2, DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase 2, humanhuman

Predictions only

Length 518 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APEX2Q9UBZ4 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
APEX2Q9UBZ4 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
APEX2Q9UBZ4 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
APEX2Q9UBZ4 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
APEX2Q9UBZ4 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
APEX2Q9UBZ4 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
APEX2Q9UBZ4 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
APEX2Q9UBZ4 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
APEX2Q9UBZ4 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
APEX2Q9UBZ4 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
APEX2Q9UBZ4 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
APEX2Q9UBZ4 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
APEX2Q9UBZ4 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
APEX2Q9UBZ4 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
APEX2Q9UBZ4 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
APEX2Q9UBZ4 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
APEX2Q9UBZ4 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
APEX2Q9UBZ4 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
APEX2Q9UBZ4 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
APEX2Q9UBZ4 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
APEX2Q9UBZ4 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
APEX2Q9UBZ4 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
APEX2Q9UBZ4 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
APEX2Q9UBZ4 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
APEX2Q9UBZ4 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
APEX2Q9UBZ4 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
APEX2Q9UBZ4 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
APEX2Q9UBZ4 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
APEX2Q9UBZ4 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
APEX2Q9UBZ4 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
APEX2Q9UBZ4 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
APEX2Q9UBZ4 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
APEX2Q9UBZ4 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
APEX2Q9UBZ4 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
APEX2Q9UBZ4 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
APEX2Q9UBZ4 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
APEX2Q9UBZ4 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
APEX2Q9UBZ4 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
APEX2Q9UBZ4 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
APEX2Q9UBZ4 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
APEX2Q9UBZ4 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
APEX2Q9UBZ4 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
APEX2Q9UBZ4 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
APEX2Q9UBZ4 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
APEX2Q9UBZ4 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
APEX2Q9UBZ4 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
APEX2Q9UBZ4 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
APEX2Q9UBZ4 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
APEX2Q9UBZ4 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
APEX2Q9UBZ4 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
APEX2Q9UBZ4 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
APEX2Q9UBZ4 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
APEX2Q9UBZ4 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
APEX2Q9UBZ4 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
APEX2Q9UBZ4 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
APEX2Q9UBZ4 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
APEX2Q9UBZ4 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
APEX2Q9UBZ4 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
APEX2Q9UBZ4 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
APEX2Q9UBZ4 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
APEX2Q9UBZ4 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
APEX2Q9UBZ4 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
APEX2Q9UBZ4 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
APEX2Q9UBZ4 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC19.14■□□□□ 0.66
APEX2Q9UBZ4 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
APEX2Q9UBZ4 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
APEX2Q9UBZ4 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
APEX2Q9UBZ4 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
APEX2Q9UBZ4 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
APEX2Q9UBZ4 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
APEX2Q9UBZ4 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
APEX2Q9UBZ4 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
APEX2Q9UBZ4 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
APEX2Q9UBZ4 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
APEX2Q9UBZ4 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
APEX2Q9UBZ4 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
APEX2Q9UBZ4 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC19.14■□□□□ 0.65
APEX2Q9UBZ4 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
APEX2Q9UBZ4 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
APEX2Q9UBZ4 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
APEX2Q9UBZ4 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC19.14■□□□□ 0.65
APEX2Q9UBZ4 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
APEX2Q9UBZ4 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.14■□□□□ 0.65
APEX2Q9UBZ4 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
APEX2Q9UBZ4 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
APEX2Q9UBZ4 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
APEX2Q9UBZ4 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
APEX2Q9UBZ4 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
APEX2Q9UBZ4 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
APEX2Q9UBZ4 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
APEX2Q9UBZ4 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
APEX2Q9UBZ4 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
APEX2Q9UBZ4 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
APEX2Q9UBZ4 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
APEX2Q9UBZ4 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
APEX2Q9UBZ4 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
APEX2Q9UBZ4 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
APEX2Q9UBZ4 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
APEX2Q9UBZ4 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
APEX2Q9UBZ4 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms