Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBP4

DKK3, Dickkopf-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DKK3Q9UBP4 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
DKK3Q9UBP4 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
DKK3Q9UBP4 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
DKK3Q9UBP4 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
DKK3Q9UBP4 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
DKK3Q9UBP4 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
DKK3Q9UBP4 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
DKK3Q9UBP4 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
DKK3Q9UBP4 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
DKK3Q9UBP4 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
DKK3Q9UBP4 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
DKK3Q9UBP4 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
DKK3Q9UBP4 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
DKK3Q9UBP4 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
DKK3Q9UBP4 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
DKK3Q9UBP4 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
DKK3Q9UBP4 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
DKK3Q9UBP4 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
DKK3Q9UBP4 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
DKK3Q9UBP4 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
DKK3Q9UBP4 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
DKK3Q9UBP4 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
DKK3Q9UBP4 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
DKK3Q9UBP4 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
DKK3Q9UBP4 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
DKK3Q9UBP4 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
DKK3Q9UBP4 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
DKK3Q9UBP4 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
DKK3Q9UBP4 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
DKK3Q9UBP4 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
DKK3Q9UBP4 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
DKK3Q9UBP4 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
DKK3Q9UBP4 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
DKK3Q9UBP4 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
DKK3Q9UBP4 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
DKK3Q9UBP4 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
DKK3Q9UBP4 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
DKK3Q9UBP4 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
DKK3Q9UBP4 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
DKK3Q9UBP4 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
DKK3Q9UBP4 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
DKK3Q9UBP4 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
DKK3Q9UBP4 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
DKK3Q9UBP4 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
DKK3Q9UBP4 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
DKK3Q9UBP4 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
DKK3Q9UBP4 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
DKK3Q9UBP4 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
DKK3Q9UBP4 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
DKK3Q9UBP4 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
DKK3Q9UBP4 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
DKK3Q9UBP4 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
DKK3Q9UBP4 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
DKK3Q9UBP4 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
DKK3Q9UBP4 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
DKK3Q9UBP4 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
DKK3Q9UBP4 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
DKK3Q9UBP4 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
DKK3Q9UBP4 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
DKK3Q9UBP4 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
DKK3Q9UBP4 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
DKK3Q9UBP4 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
DKK3Q9UBP4 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
DKK3Q9UBP4 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
DKK3Q9UBP4 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
DKK3Q9UBP4 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
DKK3Q9UBP4 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
DKK3Q9UBP4 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
DKK3Q9UBP4 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
DKK3Q9UBP4 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
DKK3Q9UBP4 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
DKK3Q9UBP4 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
DKK3Q9UBP4 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
DKK3Q9UBP4 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
DKK3Q9UBP4 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
DKK3Q9UBP4 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
DKK3Q9UBP4 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
DKK3Q9UBP4 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
DKK3Q9UBP4 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
DKK3Q9UBP4 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
DKK3Q9UBP4 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
DKK3Q9UBP4 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
DKK3Q9UBP4 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
DKK3Q9UBP4 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
DKK3Q9UBP4 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
DKK3Q9UBP4 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
DKK3Q9UBP4 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
DKK3Q9UBP4 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
DKK3Q9UBP4 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
DKK3Q9UBP4 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
DKK3Q9UBP4 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
DKK3Q9UBP4 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
DKK3Q9UBP4 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
DKK3Q9UBP4 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
DKK3Q9UBP4 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
DKK3Q9UBP4 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
DKK3Q9UBP4 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
DKK3Q9UBP4 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
DKK3Q9UBP4 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
DKK3Q9UBP4 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms