Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1F3

ABRACL, Costars family protein ABRACL, humanhuman

Predictions only

Length 81 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABRACLQ9P1F3 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ABRACLQ9P1F3 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ABRACLQ9P1F3 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ABRACLQ9P1F3 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ABRACLQ9P1F3 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ABRACLQ9P1F3 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ABRACLQ9P1F3 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ABRACLQ9P1F3 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ABRACLQ9P1F3 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
ABRACLQ9P1F3 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
ABRACLQ9P1F3 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ABRACLQ9P1F3 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ABRACLQ9P1F3 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ABRACLQ9P1F3 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ABRACLQ9P1F3 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ABRACLQ9P1F3 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ABRACLQ9P1F3 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ABRACLQ9P1F3 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ABRACLQ9P1F3 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ABRACLQ9P1F3 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ABRACLQ9P1F3 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ABRACLQ9P1F3 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ABRACLQ9P1F3 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ABRACLQ9P1F3 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ABRACLQ9P1F3 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
ABRACLQ9P1F3 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ABRACLQ9P1F3 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ABRACLQ9P1F3 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ABRACLQ9P1F3 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ABRACLQ9P1F3 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
ABRACLQ9P1F3 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ABRACLQ9P1F3 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ABRACLQ9P1F3 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ABRACLQ9P1F3 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ABRACLQ9P1F3 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ABRACLQ9P1F3 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ABRACLQ9P1F3 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ABRACLQ9P1F3 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ABRACLQ9P1F3 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
ABRACLQ9P1F3 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
ABRACLQ9P1F3 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
ABRACLQ9P1F3 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ABRACLQ9P1F3 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ABRACLQ9P1F3 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
ABRACLQ9P1F3 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
ABRACLQ9P1F3 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ABRACLQ9P1F3 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ABRACLQ9P1F3 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ABRACLQ9P1F3 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ABRACLQ9P1F3 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ABRACLQ9P1F3 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ABRACLQ9P1F3 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ABRACLQ9P1F3 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ABRACLQ9P1F3 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ABRACLQ9P1F3 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ABRACLQ9P1F3 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ABRACLQ9P1F3 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ABRACLQ9P1F3 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ABRACLQ9P1F3 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ABRACLQ9P1F3 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ABRACLQ9P1F3 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ABRACLQ9P1F3 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ABRACLQ9P1F3 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ABRACLQ9P1F3 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ABRACLQ9P1F3 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ABRACLQ9P1F3 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ABRACLQ9P1F3 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ABRACLQ9P1F3 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ABRACLQ9P1F3 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ABRACLQ9P1F3 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ABRACLQ9P1F3 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ABRACLQ9P1F3 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ABRACLQ9P1F3 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ABRACLQ9P1F3 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ABRACLQ9P1F3 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ABRACLQ9P1F3 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ABRACLQ9P1F3 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
ABRACLQ9P1F3 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ABRACLQ9P1F3 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ABRACLQ9P1F3 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ABRACLQ9P1F3 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ABRACLQ9P1F3 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ABRACLQ9P1F3 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
ABRACLQ9P1F3 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
ABRACLQ9P1F3 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ABRACLQ9P1F3 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ABRACLQ9P1F3 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ABRACLQ9P1F3 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ABRACLQ9P1F3 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
ABRACLQ9P1F3 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ABRACLQ9P1F3 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ABRACLQ9P1F3 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ABRACLQ9P1F3 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ABRACLQ9P1F3 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ABRACLQ9P1F3 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ABRACLQ9P1F3 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ABRACLQ9P1F3 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ABRACLQ9P1F3 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ABRACLQ9P1F3 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ABRACLQ9P1F3 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.4 ms