Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX63

CHCHD3, MICOS complex subunit MIC19, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHCHD3Q9NX63 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CHCHD3Q9NX63 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CHCHD3Q9NX63 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CHCHD3Q9NX63 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CHCHD3Q9NX63 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CHCHD3Q9NX63 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CHCHD3Q9NX63 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CHCHD3Q9NX63 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CHCHD3Q9NX63 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CHCHD3Q9NX63 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CHCHD3Q9NX63 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CHCHD3Q9NX63 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CHCHD3Q9NX63 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CHCHD3Q9NX63 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CHCHD3Q9NX63 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
CHCHD3Q9NX63 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CHCHD3Q9NX63 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CHCHD3Q9NX63 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CHCHD3Q9NX63 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CHCHD3Q9NX63 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CHCHD3Q9NX63 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CHCHD3Q9NX63 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CHCHD3Q9NX63 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CHCHD3Q9NX63 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CHCHD3Q9NX63 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CHCHD3Q9NX63 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CHCHD3Q9NX63 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CHCHD3Q9NX63 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CHCHD3Q9NX63 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CHCHD3Q9NX63 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CHCHD3Q9NX63 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CHCHD3Q9NX63 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CHCHD3Q9NX63 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CHCHD3Q9NX63 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CHCHD3Q9NX63 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
CHCHD3Q9NX63 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CHCHD3Q9NX63 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CHCHD3Q9NX63 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CHCHD3Q9NX63 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CHCHD3Q9NX63 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CHCHD3Q9NX63 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CHCHD3Q9NX63 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CHCHD3Q9NX63 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CHCHD3Q9NX63 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CHCHD3Q9NX63 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CHCHD3Q9NX63 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CHCHD3Q9NX63 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CHCHD3Q9NX63 FMO5-201ENST00000254090 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CHCHD3Q9NX63 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CHCHD3Q9NX63 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CHCHD3Q9NX63 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CHCHD3Q9NX63 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CHCHD3Q9NX63 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CHCHD3Q9NX63 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CHCHD3Q9NX63 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CHCHD3Q9NX63 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CHCHD3Q9NX63 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CHCHD3Q9NX63 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CHCHD3Q9NX63 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CHCHD3Q9NX63 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CHCHD3Q9NX63 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CHCHD3Q9NX63 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CHCHD3Q9NX63 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CHCHD3Q9NX63 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CHCHD3Q9NX63 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CHCHD3Q9NX63 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CHCHD3Q9NX63 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CHCHD3Q9NX63 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CHCHD3Q9NX63 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CHCHD3Q9NX63 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CHCHD3Q9NX63 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CHCHD3Q9NX63 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CHCHD3Q9NX63 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CHCHD3Q9NX63 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
CHCHD3Q9NX63 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CHCHD3Q9NX63 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CHCHD3Q9NX63 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CHCHD3Q9NX63 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CHCHD3Q9NX63 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
CHCHD3Q9NX63 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CHCHD3Q9NX63 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CHCHD3Q9NX63 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CHCHD3Q9NX63 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CHCHD3Q9NX63 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CHCHD3Q9NX63 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CHCHD3Q9NX63 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CHCHD3Q9NX63 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CHCHD3Q9NX63 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CHCHD3Q9NX63 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CHCHD3Q9NX63 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
CHCHD3Q9NX63 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CHCHD3Q9NX63 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CHCHD3Q9NX63 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CHCHD3Q9NX63 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CHCHD3Q9NX63 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CHCHD3Q9NX63 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CHCHD3Q9NX63 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CHCHD3Q9NX63 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CHCHD3Q9NX63 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CHCHD3Q9NX63 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
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