Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX04

C1orf109, Uncharacterized protein C1orf109, humanhuman

Predictions only

Length 203 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf109Q9NX04 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
C1orf109Q9NX04 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
C1orf109Q9NX04 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
C1orf109Q9NX04 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
C1orf109Q9NX04 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
C1orf109Q9NX04 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
C1orf109Q9NX04 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
C1orf109Q9NX04 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
C1orf109Q9NX04 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
C1orf109Q9NX04 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
C1orf109Q9NX04 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
C1orf109Q9NX04 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
C1orf109Q9NX04 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
C1orf109Q9NX04 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
C1orf109Q9NX04 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
C1orf109Q9NX04 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
C1orf109Q9NX04 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
C1orf109Q9NX04 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
C1orf109Q9NX04 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
C1orf109Q9NX04 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
C1orf109Q9NX04 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
C1orf109Q9NX04 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
C1orf109Q9NX04 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
C1orf109Q9NX04 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
C1orf109Q9NX04 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
C1orf109Q9NX04 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
C1orf109Q9NX04 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
C1orf109Q9NX04 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
C1orf109Q9NX04 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
C1orf109Q9NX04 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
C1orf109Q9NX04 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
C1orf109Q9NX04 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
C1orf109Q9NX04 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
C1orf109Q9NX04 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
C1orf109Q9NX04 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
C1orf109Q9NX04 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
C1orf109Q9NX04 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
C1orf109Q9NX04 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
C1orf109Q9NX04 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
C1orf109Q9NX04 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
C1orf109Q9NX04 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
C1orf109Q9NX04 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
C1orf109Q9NX04 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
C1orf109Q9NX04 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
C1orf109Q9NX04 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
C1orf109Q9NX04 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
C1orf109Q9NX04 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
C1orf109Q9NX04 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
C1orf109Q9NX04 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
C1orf109Q9NX04 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
C1orf109Q9NX04 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
C1orf109Q9NX04 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
C1orf109Q9NX04 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
C1orf109Q9NX04 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
C1orf109Q9NX04 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
C1orf109Q9NX04 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
C1orf109Q9NX04 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
C1orf109Q9NX04 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
C1orf109Q9NX04 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
C1orf109Q9NX04 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
C1orf109Q9NX04 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
C1orf109Q9NX04 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
C1orf109Q9NX04 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
C1orf109Q9NX04 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
C1orf109Q9NX04 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
C1orf109Q9NX04 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
C1orf109Q9NX04 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
C1orf109Q9NX04 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
C1orf109Q9NX04 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
C1orf109Q9NX04 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
C1orf109Q9NX04 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
C1orf109Q9NX04 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
C1orf109Q9NX04 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
C1orf109Q9NX04 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
C1orf109Q9NX04 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
C1orf109Q9NX04 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
C1orf109Q9NX04 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
C1orf109Q9NX04 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
C1orf109Q9NX04 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
C1orf109Q9NX04 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
C1orf109Q9NX04 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
C1orf109Q9NX04 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
C1orf109Q9NX04 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
C1orf109Q9NX04 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
C1orf109Q9NX04 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
C1orf109Q9NX04 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
C1orf109Q9NX04 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
C1orf109Q9NX04 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
C1orf109Q9NX04 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
C1orf109Q9NX04 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
C1orf109Q9NX04 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
C1orf109Q9NX04 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
C1orf109Q9NX04 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
C1orf109Q9NX04 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
C1orf109Q9NX04 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
C1orf109Q9NX04 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
C1orf109Q9NX04 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
C1orf109Q9NX04 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
C1orf109Q9NX04 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
C1orf109Q9NX04 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.4 ms