Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSE7

ABCC13, Putative ATP-binding cassette sub-family C member 13, humanhuman

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC13Q9NSE7 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ABCC13Q9NSE7 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ABCC13Q9NSE7 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ABCC13Q9NSE7 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ABCC13Q9NSE7 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ABCC13Q9NSE7 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ABCC13Q9NSE7 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ABCC13Q9NSE7 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ABCC13Q9NSE7 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ABCC13Q9NSE7 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ABCC13Q9NSE7 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ABCC13Q9NSE7 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ABCC13Q9NSE7 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ABCC13Q9NSE7 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ABCC13Q9NSE7 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ABCC13Q9NSE7 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ABCC13Q9NSE7 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ABCC13Q9NSE7 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ABCC13Q9NSE7 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ABCC13Q9NSE7 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ABCC13Q9NSE7 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ABCC13Q9NSE7 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ABCC13Q9NSE7 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ABCC13Q9NSE7 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ABCC13Q9NSE7 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ABCC13Q9NSE7 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ABCC13Q9NSE7 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ABCC13Q9NSE7 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ABCC13Q9NSE7 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ABCC13Q9NSE7 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
ABCC13Q9NSE7 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
ABCC13Q9NSE7 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ABCC13Q9NSE7 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ABCC13Q9NSE7 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ABCC13Q9NSE7 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ABCC13Q9NSE7 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ABCC13Q9NSE7 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ABCC13Q9NSE7 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ABCC13Q9NSE7 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.55
ABCC13Q9NSE7 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
ABCC13Q9NSE7 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ABCC13Q9NSE7 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
ABCC13Q9NSE7 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ABCC13Q9NSE7 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ABCC13Q9NSE7 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ABCC13Q9NSE7 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ABCC13Q9NSE7 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ABCC13Q9NSE7 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ABCC13Q9NSE7 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ABCC13Q9NSE7 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ABCC13Q9NSE7 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ABCC13Q9NSE7 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ABCC13Q9NSE7 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ABCC13Q9NSE7 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ABCC13Q9NSE7 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ABCC13Q9NSE7 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ABCC13Q9NSE7 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ABCC13Q9NSE7 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ABCC13Q9NSE7 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ABCC13Q9NSE7 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ABCC13Q9NSE7 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
ABCC13Q9NSE7 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ABCC13Q9NSE7 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ABCC13Q9NSE7 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ABCC13Q9NSE7 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ABCC13Q9NSE7 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ABCC13Q9NSE7 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ABCC13Q9NSE7 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ABCC13Q9NSE7 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ABCC13Q9NSE7 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ABCC13Q9NSE7 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ABCC13Q9NSE7 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ABCC13Q9NSE7 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ABCC13Q9NSE7 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ABCC13Q9NSE7 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ABCC13Q9NSE7 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ABCC13Q9NSE7 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ABCC13Q9NSE7 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ABCC13Q9NSE7 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ABCC13Q9NSE7 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ABCC13Q9NSE7 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ABCC13Q9NSE7 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ABCC13Q9NSE7 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ABCC13Q9NSE7 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ABCC13Q9NSE7 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ABCC13Q9NSE7 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ABCC13Q9NSE7 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ABCC13Q9NSE7 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ABCC13Q9NSE7 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
ABCC13Q9NSE7 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ABCC13Q9NSE7 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ABCC13Q9NSE7 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ABCC13Q9NSE7 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ABCC13Q9NSE7 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ABCC13Q9NSE7 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ABCC13Q9NSE7 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ABCC13Q9NSE7 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ABCC13Q9NSE7 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ABCC13Q9NSE7 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
ABCC13Q9NSE7 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.5 ms