Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPL8

TIMMDC1, Complex I assembly factor TIMMDC1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMMDC1Q9NPL8 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TIMMDC1Q9NPL8 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TIMMDC1Q9NPL8 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TIMMDC1Q9NPL8 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
TIMMDC1Q9NPL8 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TIMMDC1Q9NPL8 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TIMMDC1Q9NPL8 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TIMMDC1Q9NPL8 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TIMMDC1Q9NPL8 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TIMMDC1Q9NPL8 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TIMMDC1Q9NPL8 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TIMMDC1Q9NPL8 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TIMMDC1Q9NPL8 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TIMMDC1Q9NPL8 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TIMMDC1Q9NPL8 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TIMMDC1Q9NPL8 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TIMMDC1Q9NPL8 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TIMMDC1Q9NPL8 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TIMMDC1Q9NPL8 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TIMMDC1Q9NPL8 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TIMMDC1Q9NPL8 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TIMMDC1Q9NPL8 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TIMMDC1Q9NPL8 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TIMMDC1Q9NPL8 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TIMMDC1Q9NPL8 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TIMMDC1Q9NPL8 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TIMMDC1Q9NPL8 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TIMMDC1Q9NPL8 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TIMMDC1Q9NPL8 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TIMMDC1Q9NPL8 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TIMMDC1Q9NPL8 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TIMMDC1Q9NPL8 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TIMMDC1Q9NPL8 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TIMMDC1Q9NPL8 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TIMMDC1Q9NPL8 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TIMMDC1Q9NPL8 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TIMMDC1Q9NPL8 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TIMMDC1Q9NPL8 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TIMMDC1Q9NPL8 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TIMMDC1Q9NPL8 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TIMMDC1Q9NPL8 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TIMMDC1Q9NPL8 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TIMMDC1Q9NPL8 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TIMMDC1Q9NPL8 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TIMMDC1Q9NPL8 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TIMMDC1Q9NPL8 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TIMMDC1Q9NPL8 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TIMMDC1Q9NPL8 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TIMMDC1Q9NPL8 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TIMMDC1Q9NPL8 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TIMMDC1Q9NPL8 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TIMMDC1Q9NPL8 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TIMMDC1Q9NPL8 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TIMMDC1Q9NPL8 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
TIMMDC1Q9NPL8 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TIMMDC1Q9NPL8 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TIMMDC1Q9NPL8 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TIMMDC1Q9NPL8 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TIMMDC1Q9NPL8 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TIMMDC1Q9NPL8 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TIMMDC1Q9NPL8 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TIMMDC1Q9NPL8 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TIMMDC1Q9NPL8 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TIMMDC1Q9NPL8 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TIMMDC1Q9NPL8 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TIMMDC1Q9NPL8 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TIMMDC1Q9NPL8 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TIMMDC1Q9NPL8 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TIMMDC1Q9NPL8 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TIMMDC1Q9NPL8 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TIMMDC1Q9NPL8 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TIMMDC1Q9NPL8 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TIMMDC1Q9NPL8 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TIMMDC1Q9NPL8 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TIMMDC1Q9NPL8 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TIMMDC1Q9NPL8 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TIMMDC1Q9NPL8 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TIMMDC1Q9NPL8 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TIMMDC1Q9NPL8 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TIMMDC1Q9NPL8 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TIMMDC1Q9NPL8 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TIMMDC1Q9NPL8 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TIMMDC1Q9NPL8 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TIMMDC1Q9NPL8 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TIMMDC1Q9NPL8 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TIMMDC1Q9NPL8 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TIMMDC1Q9NPL8 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TIMMDC1Q9NPL8 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TIMMDC1Q9NPL8 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TIMMDC1Q9NPL8 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TIMMDC1Q9NPL8 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TIMMDC1Q9NPL8 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
TIMMDC1Q9NPL8 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TIMMDC1Q9NPL8 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TIMMDC1Q9NPL8 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
TIMMDC1Q9NPL8 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TIMMDC1Q9NPL8 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TIMMDC1Q9NPL8 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TIMMDC1Q9NPL8 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TIMMDC1Q9NPL8 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms