Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP90

RAB9B, Ras-related protein Rab-9B, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB9BQ9NP90 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RAB9BQ9NP90 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
RAB9BQ9NP90 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RAB9BQ9NP90 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RAB9BQ9NP90 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
RAB9BQ9NP90 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RAB9BQ9NP90 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
RAB9BQ9NP90 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
RAB9BQ9NP90 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
RAB9BQ9NP90 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
RAB9BQ9NP90 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
RAB9BQ9NP90 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
RAB9BQ9NP90 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
RAB9BQ9NP90 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
RAB9BQ9NP90 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
RAB9BQ9NP90 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
RAB9BQ9NP90 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.03
RAB9BQ9NP90 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
RAB9BQ9NP90 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
RAB9BQ9NP90 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
RAB9BQ9NP90 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
RAB9BQ9NP90 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
RAB9BQ9NP90 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
RAB9BQ9NP90 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
RAB9BQ9NP90 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
RAB9BQ9NP90 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
RAB9BQ9NP90 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
RAB9BQ9NP90 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
RAB9BQ9NP90 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
RAB9BQ9NP90 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
RAB9BQ9NP90 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
RAB9BQ9NP90 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
RAB9BQ9NP90 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
RAB9BQ9NP90 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
RAB9BQ9NP90 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
RAB9BQ9NP90 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
RAB9BQ9NP90 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
RAB9BQ9NP90 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
RAB9BQ9NP90 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
RAB9BQ9NP90 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC14.83□□□□□ -0.04
RAB9BQ9NP90 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
RAB9BQ9NP90 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
RAB9BQ9NP90 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
RAB9BQ9NP90 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
RAB9BQ9NP90 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
RAB9BQ9NP90 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
RAB9BQ9NP90 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
RAB9BQ9NP90 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
RAB9BQ9NP90 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
RAB9BQ9NP90 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
RAB9BQ9NP90 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
RAB9BQ9NP90 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
RAB9BQ9NP90 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
RAB9BQ9NP90 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
RAB9BQ9NP90 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
RAB9BQ9NP90 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
RAB9BQ9NP90 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
RAB9BQ9NP90 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
RAB9BQ9NP90 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
RAB9BQ9NP90 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
RAB9BQ9NP90 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
RAB9BQ9NP90 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
RAB9BQ9NP90 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RAB9BQ9NP90 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RAB9BQ9NP90 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
RAB9BQ9NP90 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
RAB9BQ9NP90 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
RAB9BQ9NP90 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RAB9BQ9NP90 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RAB9BQ9NP90 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
RAB9BQ9NP90 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RAB9BQ9NP90 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
RAB9BQ9NP90 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
RAB9BQ9NP90 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
RAB9BQ9NP90 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RAB9BQ9NP90 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RAB9BQ9NP90 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
RAB9BQ9NP90 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RAB9BQ9NP90 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
RAB9BQ9NP90 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
RAB9BQ9NP90 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RAB9BQ9NP90 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RAB9BQ9NP90 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
RAB9BQ9NP90 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
RAB9BQ9NP90 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
RAB9BQ9NP90 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
RAB9BQ9NP90 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
RAB9BQ9NP90 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
RAB9BQ9NP90 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RAB9BQ9NP90 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
RAB9BQ9NP90 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
RAB9BQ9NP90 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RAB9BQ9NP90 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RAB9BQ9NP90 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RAB9BQ9NP90 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RAB9BQ9NP90 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RAB9BQ9NP90 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RAB9BQ9NP90 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RAB9BQ9NP90 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RAB9BQ9NP90 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms