Protein–RNA interactions for Protein: Q9HDB9

ERVK-5, Endogenous retrovirus group K member 5 Gag polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 667 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK-5Q9HDB9 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
ERVK-5Q9HDB9 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
ERVK-5Q9HDB9 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ERVK-5Q9HDB9 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ERVK-5Q9HDB9 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ERVK-5Q9HDB9 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ERVK-5Q9HDB9 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ERVK-5Q9HDB9 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ERVK-5Q9HDB9 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ERVK-5Q9HDB9 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ERVK-5Q9HDB9 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ERVK-5Q9HDB9 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ERVK-5Q9HDB9 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ERVK-5Q9HDB9 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ERVK-5Q9HDB9 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ERVK-5Q9HDB9 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ERVK-5Q9HDB9 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ERVK-5Q9HDB9 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ERVK-5Q9HDB9 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ERVK-5Q9HDB9 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ERVK-5Q9HDB9 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ERVK-5Q9HDB9 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ERVK-5Q9HDB9 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ERVK-5Q9HDB9 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ERVK-5Q9HDB9 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ERVK-5Q9HDB9 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ERVK-5Q9HDB9 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ERVK-5Q9HDB9 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
ERVK-5Q9HDB9 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ERVK-5Q9HDB9 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ERVK-5Q9HDB9 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ERVK-5Q9HDB9 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ERVK-5Q9HDB9 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ERVK-5Q9HDB9 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ERVK-5Q9HDB9 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ERVK-5Q9HDB9 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ERVK-5Q9HDB9 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ERVK-5Q9HDB9 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ERVK-5Q9HDB9 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ERVK-5Q9HDB9 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ERVK-5Q9HDB9 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ERVK-5Q9HDB9 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ERVK-5Q9HDB9 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ERVK-5Q9HDB9 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ERVK-5Q9HDB9 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ERVK-5Q9HDB9 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ERVK-5Q9HDB9 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ERVK-5Q9HDB9 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ERVK-5Q9HDB9 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ERVK-5Q9HDB9 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ERVK-5Q9HDB9 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ERVK-5Q9HDB9 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ERVK-5Q9HDB9 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
ERVK-5Q9HDB9 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ERVK-5Q9HDB9 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
ERVK-5Q9HDB9 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
ERVK-5Q9HDB9 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ERVK-5Q9HDB9 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ERVK-5Q9HDB9 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ERVK-5Q9HDB9 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ERVK-5Q9HDB9 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ERVK-5Q9HDB9 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ERVK-5Q9HDB9 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ERVK-5Q9HDB9 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ERVK-5Q9HDB9 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
ERVK-5Q9HDB9 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
ERVK-5Q9HDB9 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC19.58■□□□□ 0.73
ERVK-5Q9HDB9 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
ERVK-5Q9HDB9 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ERVK-5Q9HDB9 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ERVK-5Q9HDB9 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ERVK-5Q9HDB9 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ERVK-5Q9HDB9 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ERVK-5Q9HDB9 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ERVK-5Q9HDB9 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ERVK-5Q9HDB9 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ERVK-5Q9HDB9 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ERVK-5Q9HDB9 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ERVK-5Q9HDB9 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ERVK-5Q9HDB9 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ERVK-5Q9HDB9 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ERVK-5Q9HDB9 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ERVK-5Q9HDB9 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ERVK-5Q9HDB9 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ERVK-5Q9HDB9 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ERVK-5Q9HDB9 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ERVK-5Q9HDB9 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ERVK-5Q9HDB9 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ERVK-5Q9HDB9 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ERVK-5Q9HDB9 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ERVK-5Q9HDB9 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ERVK-5Q9HDB9 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ERVK-5Q9HDB9 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ERVK-5Q9HDB9 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ERVK-5Q9HDB9 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ERVK-5Q9HDB9 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ERVK-5Q9HDB9 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ERVK-5Q9HDB9 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ERVK-5Q9HDB9 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ERVK-5Q9HDB9 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms