Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4D0

CLSTN2, Calsyntenin-2, humanhuman

Predictions only

Length 955 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSTN2Q9H4D0 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CLSTN2Q9H4D0 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CLSTN2Q9H4D0 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CLSTN2Q9H4D0 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CLSTN2Q9H4D0 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CLSTN2Q9H4D0 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CLSTN2Q9H4D0 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CLSTN2Q9H4D0 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CLSTN2Q9H4D0 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CLSTN2Q9H4D0 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CLSTN2Q9H4D0 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CLSTN2Q9H4D0 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CLSTN2Q9H4D0 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CLSTN2Q9H4D0 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CLSTN2Q9H4D0 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CLSTN2Q9H4D0 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CLSTN2Q9H4D0 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CLSTN2Q9H4D0 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CLSTN2Q9H4D0 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
CLSTN2Q9H4D0 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CLSTN2Q9H4D0 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CLSTN2Q9H4D0 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CLSTN2Q9H4D0 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CLSTN2Q9H4D0 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CLSTN2Q9H4D0 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CLSTN2Q9H4D0 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CLSTN2Q9H4D0 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
CLSTN2Q9H4D0 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CLSTN2Q9H4D0 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CLSTN2Q9H4D0 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CLSTN2Q9H4D0 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CLSTN2Q9H4D0 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CLSTN2Q9H4D0 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CLSTN2Q9H4D0 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CLSTN2Q9H4D0 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CLSTN2Q9H4D0 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CLSTN2Q9H4D0 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CLSTN2Q9H4D0 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CLSTN2Q9H4D0 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CLSTN2Q9H4D0 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CLSTN2Q9H4D0 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CLSTN2Q9H4D0 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CLSTN2Q9H4D0 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CLSTN2Q9H4D0 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CLSTN2Q9H4D0 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CLSTN2Q9H4D0 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CLSTN2Q9H4D0 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CLSTN2Q9H4D0 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CLSTN2Q9H4D0 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CLSTN2Q9H4D0 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CLSTN2Q9H4D0 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CLSTN2Q9H4D0 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CLSTN2Q9H4D0 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CLSTN2Q9H4D0 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CLSTN2Q9H4D0 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CLSTN2Q9H4D0 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CLSTN2Q9H4D0 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CLSTN2Q9H4D0 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CLSTN2Q9H4D0 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CLSTN2Q9H4D0 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CLSTN2Q9H4D0 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CLSTN2Q9H4D0 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CLSTN2Q9H4D0 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
CLSTN2Q9H4D0 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CLSTN2Q9H4D0 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CLSTN2Q9H4D0 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
CLSTN2Q9H4D0 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CLSTN2Q9H4D0 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CLSTN2Q9H4D0 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CLSTN2Q9H4D0 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CLSTN2Q9H4D0 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CLSTN2Q9H4D0 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CLSTN2Q9H4D0 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CLSTN2Q9H4D0 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CLSTN2Q9H4D0 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CLSTN2Q9H4D0 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CLSTN2Q9H4D0 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CLSTN2Q9H4D0 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CLSTN2Q9H4D0 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CLSTN2Q9H4D0 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CLSTN2Q9H4D0 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CLSTN2Q9H4D0 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CLSTN2Q9H4D0 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CLSTN2Q9H4D0 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CLSTN2Q9H4D0 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CLSTN2Q9H4D0 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CLSTN2Q9H4D0 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CLSTN2Q9H4D0 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CLSTN2Q9H4D0 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CLSTN2Q9H4D0 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CLSTN2Q9H4D0 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
CLSTN2Q9H4D0 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CLSTN2Q9H4D0 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CLSTN2Q9H4D0 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CLSTN2Q9H4D0 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CLSTN2Q9H4D0 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
CLSTN2Q9H4D0 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CLSTN2Q9H4D0 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CLSTN2Q9H4D0 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CLSTN2Q9H4D0 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms