Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0U4

RAB1B, Ras-related protein Rab-1B, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB1BQ9H0U4 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RAB1BQ9H0U4 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RAB1BQ9H0U4 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC15.06■□□□□ 0
RAB1BQ9H0U4 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RAB1BQ9H0U4 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RAB1BQ9H0U4 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RAB1BQ9H0U4 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
RAB1BQ9H0U4 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RAB1BQ9H0U4 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RAB1BQ9H0U4 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RAB1BQ9H0U4 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RAB1BQ9H0U4 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
RAB1BQ9H0U4 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
RAB1BQ9H0U4 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RAB1BQ9H0U4 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC15.06■□□□□ 0
RAB1BQ9H0U4 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RAB1BQ9H0U4 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RAB1BQ9H0U4 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RAB1BQ9H0U4 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RAB1BQ9H0U4 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RAB1BQ9H0U4 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RAB1BQ9H0U4 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RAB1BQ9H0U4 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RAB1BQ9H0U4 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RAB1BQ9H0U4 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RAB1BQ9H0U4 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RAB1BQ9H0U4 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RAB1BQ9H0U4 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RAB1BQ9H0U4 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RAB1BQ9H0U4 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RAB1BQ9H0U4 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RAB1BQ9H0U4 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RAB1BQ9H0U4 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RAB1BQ9H0U4 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RAB1BQ9H0U4 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RAB1BQ9H0U4 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
RAB1BQ9H0U4 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RAB1BQ9H0U4 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
RAB1BQ9H0U4 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RAB1BQ9H0U4 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RAB1BQ9H0U4 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
RAB1BQ9H0U4 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RAB1BQ9H0U4 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
RAB1BQ9H0U4 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RAB1BQ9H0U4 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
RAB1BQ9H0U4 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RAB1BQ9H0U4 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RAB1BQ9H0U4 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RAB1BQ9H0U4 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
RAB1BQ9H0U4 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RAB1BQ9H0U4 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RAB1BQ9H0U4 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
RAB1BQ9H0U4 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
RAB1BQ9H0U4 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RAB1BQ9H0U4 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
RAB1BQ9H0U4 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RAB1BQ9H0U4 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC15.05■□□□□ -0
RAB1BQ9H0U4 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RAB1BQ9H0U4 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RAB1BQ9H0U4 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RAB1BQ9H0U4 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
RAB1BQ9H0U4 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RAB1BQ9H0U4 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
RAB1BQ9H0U4 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RAB1BQ9H0U4 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RAB1BQ9H0U4 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RAB1BQ9H0U4 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RAB1BQ9H0U4 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RAB1BQ9H0U4 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RAB1BQ9H0U4 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RAB1BQ9H0U4 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RAB1BQ9H0U4 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RAB1BQ9H0U4 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RAB1BQ9H0U4 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RAB1BQ9H0U4 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RAB1BQ9H0U4 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RAB1BQ9H0U4 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RAB1BQ9H0U4 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
RAB1BQ9H0U4 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RAB1BQ9H0U4 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RAB1BQ9H0U4 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RAB1BQ9H0U4 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RAB1BQ9H0U4 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
RAB1BQ9H0U4 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
RAB1BQ9H0U4 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RAB1BQ9H0U4 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RAB1BQ9H0U4 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
RAB1BQ9H0U4 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RAB1BQ9H0U4 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RAB1BQ9H0U4 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RAB1BQ9H0U4 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
RAB1BQ9H0U4 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RAB1BQ9H0U4 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RAB1BQ9H0U4 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RAB1BQ9H0U4 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RAB1BQ9H0U4 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RAB1BQ9H0U4 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
RAB1BQ9H0U4 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RAB1BQ9H0U4 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RAB1BQ9H0U4 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.4 ms