Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0J9

BHLHE41, Class E basic helix-loop-helix protein 41, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHE41Q9C0J9 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
BHLHE41Q9C0J9 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
BHLHE41Q9C0J9 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
BHLHE41Q9C0J9 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
BHLHE41Q9C0J9 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
BHLHE41Q9C0J9 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
BHLHE41Q9C0J9 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
BHLHE41Q9C0J9 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
BHLHE41Q9C0J9 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
BHLHE41Q9C0J9 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
BHLHE41Q9C0J9 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
BHLHE41Q9C0J9 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
BHLHE41Q9C0J9 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
BHLHE41Q9C0J9 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
BHLHE41Q9C0J9 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
BHLHE41Q9C0J9 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
BHLHE41Q9C0J9 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
BHLHE41Q9C0J9 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
BHLHE41Q9C0J9 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
BHLHE41Q9C0J9 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
BHLHE41Q9C0J9 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
BHLHE41Q9C0J9 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
BHLHE41Q9C0J9 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
BHLHE41Q9C0J9 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
BHLHE41Q9C0J9 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
BHLHE41Q9C0J9 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
BHLHE41Q9C0J9 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
BHLHE41Q9C0J9 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
BHLHE41Q9C0J9 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
BHLHE41Q9C0J9 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
BHLHE41Q9C0J9 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
BHLHE41Q9C0J9 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
BHLHE41Q9C0J9 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
BHLHE41Q9C0J9 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
BHLHE41Q9C0J9 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
BHLHE41Q9C0J9 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
BHLHE41Q9C0J9 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
BHLHE41Q9C0J9 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
BHLHE41Q9C0J9 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
BHLHE41Q9C0J9 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
BHLHE41Q9C0J9 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
BHLHE41Q9C0J9 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
BHLHE41Q9C0J9 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
BHLHE41Q9C0J9 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
BHLHE41Q9C0J9 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
BHLHE41Q9C0J9 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
BHLHE41Q9C0J9 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
BHLHE41Q9C0J9 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
BHLHE41Q9C0J9 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
BHLHE41Q9C0J9 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
BHLHE41Q9C0J9 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
BHLHE41Q9C0J9 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
BHLHE41Q9C0J9 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
BHLHE41Q9C0J9 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
BHLHE41Q9C0J9 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
BHLHE41Q9C0J9 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
BHLHE41Q9C0J9 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
BHLHE41Q9C0J9 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
BHLHE41Q9C0J9 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
BHLHE41Q9C0J9 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
BHLHE41Q9C0J9 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
BHLHE41Q9C0J9 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
BHLHE41Q9C0J9 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
BHLHE41Q9C0J9 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
BHLHE41Q9C0J9 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
BHLHE41Q9C0J9 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
BHLHE41Q9C0J9 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
BHLHE41Q9C0J9 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
BHLHE41Q9C0J9 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
BHLHE41Q9C0J9 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
BHLHE41Q9C0J9 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
BHLHE41Q9C0J9 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
BHLHE41Q9C0J9 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
BHLHE41Q9C0J9 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
BHLHE41Q9C0J9 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
BHLHE41Q9C0J9 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
BHLHE41Q9C0J9 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
BHLHE41Q9C0J9 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
BHLHE41Q9C0J9 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
BHLHE41Q9C0J9 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
BHLHE41Q9C0J9 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
BHLHE41Q9C0J9 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
BHLHE41Q9C0J9 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
BHLHE41Q9C0J9 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
BHLHE41Q9C0J9 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
BHLHE41Q9C0J9 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
BHLHE41Q9C0J9 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
BHLHE41Q9C0J9 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
BHLHE41Q9C0J9 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
BHLHE41Q9C0J9 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
BHLHE41Q9C0J9 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
BHLHE41Q9C0J9 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
BHLHE41Q9C0J9 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
BHLHE41Q9C0J9 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
BHLHE41Q9C0J9 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
BHLHE41Q9C0J9 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
BHLHE41Q9C0J9 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
BHLHE41Q9C0J9 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
BHLHE41Q9C0J9 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
BHLHE41Q9C0J9 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms