Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0F1

CEP44, Centrosomal protein of 44 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP44Q9C0F1 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CEP44Q9C0F1 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CEP44Q9C0F1 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CEP44Q9C0F1 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CEP44Q9C0F1 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CEP44Q9C0F1 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CEP44Q9C0F1 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CEP44Q9C0F1 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CEP44Q9C0F1 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CEP44Q9C0F1 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CEP44Q9C0F1 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CEP44Q9C0F1 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CEP44Q9C0F1 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CEP44Q9C0F1 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CEP44Q9C0F1 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CEP44Q9C0F1 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CEP44Q9C0F1 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CEP44Q9C0F1 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CEP44Q9C0F1 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CEP44Q9C0F1 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CEP44Q9C0F1 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CEP44Q9C0F1 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CEP44Q9C0F1 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CEP44Q9C0F1 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CEP44Q9C0F1 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CEP44Q9C0F1 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CEP44Q9C0F1 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CEP44Q9C0F1 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CEP44Q9C0F1 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CEP44Q9C0F1 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CEP44Q9C0F1 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CEP44Q9C0F1 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CEP44Q9C0F1 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CEP44Q9C0F1 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CEP44Q9C0F1 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CEP44Q9C0F1 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CEP44Q9C0F1 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CEP44Q9C0F1 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CEP44Q9C0F1 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CEP44Q9C0F1 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CEP44Q9C0F1 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CEP44Q9C0F1 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CEP44Q9C0F1 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CEP44Q9C0F1 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CEP44Q9C0F1 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CEP44Q9C0F1 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CEP44Q9C0F1 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CEP44Q9C0F1 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CEP44Q9C0F1 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CEP44Q9C0F1 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CEP44Q9C0F1 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CEP44Q9C0F1 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CEP44Q9C0F1 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CEP44Q9C0F1 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CEP44Q9C0F1 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CEP44Q9C0F1 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CEP44Q9C0F1 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CEP44Q9C0F1 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CEP44Q9C0F1 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CEP44Q9C0F1 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CEP44Q9C0F1 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CEP44Q9C0F1 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CEP44Q9C0F1 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CEP44Q9C0F1 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CEP44Q9C0F1 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CEP44Q9C0F1 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CEP44Q9C0F1 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CEP44Q9C0F1 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CEP44Q9C0F1 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CEP44Q9C0F1 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CEP44Q9C0F1 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CEP44Q9C0F1 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CEP44Q9C0F1 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CEP44Q9C0F1 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CEP44Q9C0F1 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CEP44Q9C0F1 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CEP44Q9C0F1 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CEP44Q9C0F1 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CEP44Q9C0F1 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CEP44Q9C0F1 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CEP44Q9C0F1 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CEP44Q9C0F1 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CEP44Q9C0F1 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CEP44Q9C0F1 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CEP44Q9C0F1 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CEP44Q9C0F1 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CEP44Q9C0F1 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CEP44Q9C0F1 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CEP44Q9C0F1 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CEP44Q9C0F1 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CEP44Q9C0F1 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CEP44Q9C0F1 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CEP44Q9C0F1 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CEP44Q9C0F1 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CEP44Q9C0F1 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CEP44Q9C0F1 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CEP44Q9C0F1 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CEP44Q9C0F1 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CEP44Q9C0F1 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CEP44Q9C0F1 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms