Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0F0

ASXL3, Putative Polycomb group protein ASXL3, humanhuman

Predictions only

Length 2,248 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASXL3Q9C0F0 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ASXL3Q9C0F0 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ASXL3Q9C0F0 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ASXL3Q9C0F0 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ASXL3Q9C0F0 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ASXL3Q9C0F0 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ASXL3Q9C0F0 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ASXL3Q9C0F0 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ASXL3Q9C0F0 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ASXL3Q9C0F0 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ASXL3Q9C0F0 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ASXL3Q9C0F0 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ASXL3Q9C0F0 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
ASXL3Q9C0F0 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
ASXL3Q9C0F0 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ASXL3Q9C0F0 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
ASXL3Q9C0F0 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ASXL3Q9C0F0 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ASXL3Q9C0F0 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ASXL3Q9C0F0 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ASXL3Q9C0F0 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ASXL3Q9C0F0 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ASXL3Q9C0F0 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ASXL3Q9C0F0 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ASXL3Q9C0F0 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ASXL3Q9C0F0 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ASXL3Q9C0F0 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ASXL3Q9C0F0 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ASXL3Q9C0F0 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ASXL3Q9C0F0 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
ASXL3Q9C0F0 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
ASXL3Q9C0F0 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ASXL3Q9C0F0 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
ASXL3Q9C0F0 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ASXL3Q9C0F0 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ASXL3Q9C0F0 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ASXL3Q9C0F0 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ASXL3Q9C0F0 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ASXL3Q9C0F0 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ASXL3Q9C0F0 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ASXL3Q9C0F0 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ASXL3Q9C0F0 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ASXL3Q9C0F0 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ASXL3Q9C0F0 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ASXL3Q9C0F0 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ASXL3Q9C0F0 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ASXL3Q9C0F0 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ASXL3Q9C0F0 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ASXL3Q9C0F0 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ASXL3Q9C0F0 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ASXL3Q9C0F0 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
ASXL3Q9C0F0 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ASXL3Q9C0F0 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ASXL3Q9C0F0 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ASXL3Q9C0F0 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ASXL3Q9C0F0 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ASXL3Q9C0F0 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ASXL3Q9C0F0 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ASXL3Q9C0F0 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ASXL3Q9C0F0 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ASXL3Q9C0F0 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ASXL3Q9C0F0 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
ASXL3Q9C0F0 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
ASXL3Q9C0F0 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ASXL3Q9C0F0 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ASXL3Q9C0F0 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ASXL3Q9C0F0 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ASXL3Q9C0F0 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ASXL3Q9C0F0 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ASXL3Q9C0F0 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ASXL3Q9C0F0 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
ASXL3Q9C0F0 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ASXL3Q9C0F0 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ASXL3Q9C0F0 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ASXL3Q9C0F0 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ASXL3Q9C0F0 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
ASXL3Q9C0F0 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ASXL3Q9C0F0 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ASXL3Q9C0F0 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ASXL3Q9C0F0 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ASXL3Q9C0F0 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ASXL3Q9C0F0 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ASXL3Q9C0F0 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ASXL3Q9C0F0 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ASXL3Q9C0F0 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ASXL3Q9C0F0 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
ASXL3Q9C0F0 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ASXL3Q9C0F0 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
ASXL3Q9C0F0 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ASXL3Q9C0F0 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ASXL3Q9C0F0 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ASXL3Q9C0F0 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
ASXL3Q9C0F0 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ASXL3Q9C0F0 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ASXL3Q9C0F0 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ASXL3Q9C0F0 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
ASXL3Q9C0F0 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
ASXL3Q9C0F0 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
ASXL3Q9C0F0 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ASXL3Q9C0F0 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.2 ms