Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYG3

NIFK, MKI67 FHA domain-interacting nucleolar phosphoprotein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIFKQ9BYG3 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
NIFKQ9BYG3 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
NIFKQ9BYG3 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
NIFKQ9BYG3 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
NIFKQ9BYG3 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
NIFKQ9BYG3 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
NIFKQ9BYG3 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
NIFKQ9BYG3 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
NIFKQ9BYG3 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
NIFKQ9BYG3 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
NIFKQ9BYG3 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
NIFKQ9BYG3 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
NIFKQ9BYG3 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC19.56■□□□□ 0.72
NIFKQ9BYG3 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
NIFKQ9BYG3 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
NIFKQ9BYG3 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
NIFKQ9BYG3 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
NIFKQ9BYG3 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
NIFKQ9BYG3 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
NIFKQ9BYG3 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
NIFKQ9BYG3 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
NIFKQ9BYG3 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
NIFKQ9BYG3 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
NIFKQ9BYG3 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
NIFKQ9BYG3 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
NIFKQ9BYG3 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
NIFKQ9BYG3 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
NIFKQ9BYG3 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
NIFKQ9BYG3 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
NIFKQ9BYG3 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
NIFKQ9BYG3 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
NIFKQ9BYG3 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
NIFKQ9BYG3 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
NIFKQ9BYG3 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
NIFKQ9BYG3 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
NIFKQ9BYG3 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
NIFKQ9BYG3 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
NIFKQ9BYG3 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
NIFKQ9BYG3 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
NIFKQ9BYG3 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
NIFKQ9BYG3 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
NIFKQ9BYG3 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
NIFKQ9BYG3 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
NIFKQ9BYG3 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
NIFKQ9BYG3 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
NIFKQ9BYG3 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
NIFKQ9BYG3 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
NIFKQ9BYG3 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
NIFKQ9BYG3 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
NIFKQ9BYG3 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
NIFKQ9BYG3 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
NIFKQ9BYG3 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
NIFKQ9BYG3 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
NIFKQ9BYG3 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
NIFKQ9BYG3 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
NIFKQ9BYG3 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
NIFKQ9BYG3 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
NIFKQ9BYG3 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
NIFKQ9BYG3 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
NIFKQ9BYG3 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
NIFKQ9BYG3 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
NIFKQ9BYG3 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
NIFKQ9BYG3 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
NIFKQ9BYG3 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
NIFKQ9BYG3 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
NIFKQ9BYG3 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
NIFKQ9BYG3 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
NIFKQ9BYG3 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
NIFKQ9BYG3 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
NIFKQ9BYG3 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
NIFKQ9BYG3 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
NIFKQ9BYG3 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
NIFKQ9BYG3 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
NIFKQ9BYG3 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
NIFKQ9BYG3 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
NIFKQ9BYG3 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
NIFKQ9BYG3 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
NIFKQ9BYG3 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
NIFKQ9BYG3 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
NIFKQ9BYG3 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
NIFKQ9BYG3 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
NIFKQ9BYG3 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
NIFKQ9BYG3 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
NIFKQ9BYG3 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
NIFKQ9BYG3 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
NIFKQ9BYG3 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
NIFKQ9BYG3 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
NIFKQ9BYG3 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC19.54■□□□□ 0.72
NIFKQ9BYG3 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
NIFKQ9BYG3 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
NIFKQ9BYG3 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
NIFKQ9BYG3 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
NIFKQ9BYG3 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
NIFKQ9BYG3 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
NIFKQ9BYG3 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
NIFKQ9BYG3 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
NIFKQ9BYG3 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
NIFKQ9BYG3 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
NIFKQ9BYG3 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
NIFKQ9BYG3 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms