Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY49

PECR, Peroxisomal trans-2-enoyl-CoA reductase, humanhuman

Predictions only

Length 303 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PECRQ9BY49 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
PECRQ9BY49 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
PECRQ9BY49 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PECRQ9BY49 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PECRQ9BY49 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PECRQ9BY49 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PECRQ9BY49 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PECRQ9BY49 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
PECRQ9BY49 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PECRQ9BY49 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
PECRQ9BY49 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
PECRQ9BY49 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PECRQ9BY49 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PECRQ9BY49 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
PECRQ9BY49 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
PECRQ9BY49 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PECRQ9BY49 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PECRQ9BY49 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PECRQ9BY49 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
PECRQ9BY49 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PECRQ9BY49 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PECRQ9BY49 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PECRQ9BY49 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PECRQ9BY49 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PECRQ9BY49 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PECRQ9BY49 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PECRQ9BY49 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PECRQ9BY49 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PECRQ9BY49 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PECRQ9BY49 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PECRQ9BY49 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PECRQ9BY49 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PECRQ9BY49 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PECRQ9BY49 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PECRQ9BY49 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PECRQ9BY49 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PECRQ9BY49 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PECRQ9BY49 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PECRQ9BY49 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PECRQ9BY49 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PECRQ9BY49 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PECRQ9BY49 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PECRQ9BY49 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PECRQ9BY49 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PECRQ9BY49 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
PECRQ9BY49 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PECRQ9BY49 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
PECRQ9BY49 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PECRQ9BY49 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PECRQ9BY49 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PECRQ9BY49 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PECRQ9BY49 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PECRQ9BY49 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PECRQ9BY49 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PECRQ9BY49 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PECRQ9BY49 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PECRQ9BY49 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PECRQ9BY49 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PECRQ9BY49 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PECRQ9BY49 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PECRQ9BY49 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PECRQ9BY49 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PECRQ9BY49 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PECRQ9BY49 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PECRQ9BY49 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PECRQ9BY49 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PECRQ9BY49 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PECRQ9BY49 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PECRQ9BY49 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PECRQ9BY49 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PECRQ9BY49 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PECRQ9BY49 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PECRQ9BY49 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PECRQ9BY49 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
PECRQ9BY49 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PECRQ9BY49 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PECRQ9BY49 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PECRQ9BY49 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
PECRQ9BY49 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PECRQ9BY49 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PECRQ9BY49 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PECRQ9BY49 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PECRQ9BY49 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PECRQ9BY49 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PECRQ9BY49 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PECRQ9BY49 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PECRQ9BY49 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PECRQ9BY49 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PECRQ9BY49 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PECRQ9BY49 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PECRQ9BY49 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PECRQ9BY49 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PECRQ9BY49 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PECRQ9BY49 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PECRQ9BY49 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
PECRQ9BY49 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PECRQ9BY49 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PECRQ9BY49 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PECRQ9BY49 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PECRQ9BY49 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.5 ms