Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX97

PLVAP, Plasmalemma vesicle-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLVAPQ9BX97 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.74
PLVAPQ9BX97 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
PLVAPQ9BX97 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PLVAPQ9BX97 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PLVAPQ9BX97 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PLVAPQ9BX97 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PLVAPQ9BX97 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PLVAPQ9BX97 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
PLVAPQ9BX97 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
PLVAPQ9BX97 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
PLVAPQ9BX97 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
PLVAPQ9BX97 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
PLVAPQ9BX97 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
PLVAPQ9BX97 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
PLVAPQ9BX97 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
PLVAPQ9BX97 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
PLVAPQ9BX97 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PLVAPQ9BX97 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PLVAPQ9BX97 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
PLVAPQ9BX97 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
PLVAPQ9BX97 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
PLVAPQ9BX97 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PLVAPQ9BX97 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PLVAPQ9BX97 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PLVAPQ9BX97 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PLVAPQ9BX97 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PLVAPQ9BX97 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PLVAPQ9BX97 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PLVAPQ9BX97 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PLVAPQ9BX97 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PLVAPQ9BX97 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
PLVAPQ9BX97 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PLVAPQ9BX97 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PLVAPQ9BX97 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PLVAPQ9BX97 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PLVAPQ9BX97 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PLVAPQ9BX97 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PLVAPQ9BX97 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
PLVAPQ9BX97 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PLVAPQ9BX97 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PLVAPQ9BX97 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PLVAPQ9BX97 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
PLVAPQ9BX97 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
PLVAPQ9BX97 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PLVAPQ9BX97 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PLVAPQ9BX97 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PLVAPQ9BX97 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PLVAPQ9BX97 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PLVAPQ9BX97 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PLVAPQ9BX97 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PLVAPQ9BX97 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PLVAPQ9BX97 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PLVAPQ9BX97 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
PLVAPQ9BX97 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PLVAPQ9BX97 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PLVAPQ9BX97 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PLVAPQ9BX97 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PLVAPQ9BX97 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PLVAPQ9BX97 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PLVAPQ9BX97 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
PLVAPQ9BX97 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PLVAPQ9BX97 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PLVAPQ9BX97 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PLVAPQ9BX97 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PLVAPQ9BX97 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PLVAPQ9BX97 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PLVAPQ9BX97 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PLVAPQ9BX97 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PLVAPQ9BX97 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PLVAPQ9BX97 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PLVAPQ9BX97 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PLVAPQ9BX97 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PLVAPQ9BX97 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
PLVAPQ9BX97 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PLVAPQ9BX97 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PLVAPQ9BX97 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PLVAPQ9BX97 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PLVAPQ9BX97 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
PLVAPQ9BX97 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PLVAPQ9BX97 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PLVAPQ9BX97 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PLVAPQ9BX97 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PLVAPQ9BX97 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PLVAPQ9BX97 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PLVAPQ9BX97 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PLVAPQ9BX97 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PLVAPQ9BX97 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PLVAPQ9BX97 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PLVAPQ9BX97 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PLVAPQ9BX97 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PLVAPQ9BX97 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PLVAPQ9BX97 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
PLVAPQ9BX97 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
PLVAPQ9BX97 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PLVAPQ9BX97 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PLVAPQ9BX97 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PLVAPQ9BX97 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
PLVAPQ9BX97 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PLVAPQ9BX97 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PLVAPQ9BX97 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms