Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW11

MXD3, Max dimerization protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MXD3Q9BW11 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC21.3■■□□□ 1
MXD3Q9BW11 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC21.3■■□□□ 1
MXD3Q9BW11 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
MXD3Q9BW11 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
MXD3Q9BW11 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MXD3Q9BW11 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
MXD3Q9BW11 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MXD3Q9BW11 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MXD3Q9BW11 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
MXD3Q9BW11 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MXD3Q9BW11 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MXD3Q9BW11 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
MXD3Q9BW11 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC21.29■■□□□ 1
MXD3Q9BW11 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MXD3Q9BW11 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MXD3Q9BW11 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC21.29■■□□□ 1
MXD3Q9BW11 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
MXD3Q9BW11 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MXD3Q9BW11 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MXD3Q9BW11 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MXD3Q9BW11 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
MXD3Q9BW11 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MXD3Q9BW11 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MXD3Q9BW11 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MXD3Q9BW11 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MXD3Q9BW11 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
MXD3Q9BW11 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
MXD3Q9BW11 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
MXD3Q9BW11 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC21.29■■□□□ 1
MXD3Q9BW11 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC21.29■■□□□ 1
MXD3Q9BW11 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC21.29■■□□□ 1
MXD3Q9BW11 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
MXD3Q9BW11 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
MXD3Q9BW11 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
MXD3Q9BW11 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
MXD3Q9BW11 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC21.29■■□□□ 1
MXD3Q9BW11 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
MXD3Q9BW11 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MXD3Q9BW11 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
MXD3Q9BW11 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MXD3Q9BW11 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MXD3Q9BW11 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MXD3Q9BW11 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC21.29■■□□□ 1
MXD3Q9BW11 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MXD3Q9BW11 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MXD3Q9BW11 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MXD3Q9BW11 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MXD3Q9BW11 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MXD3Q9BW11 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MXD3Q9BW11 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MXD3Q9BW11 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC21.28■■□□□ 1
MXD3Q9BW11 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
MXD3Q9BW11 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC21.28■■□□□ 1
MXD3Q9BW11 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
MXD3Q9BW11 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
MXD3Q9BW11 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
MXD3Q9BW11 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
MXD3Q9BW11 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC21.28■■□□□ 1
MXD3Q9BW11 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MXD3Q9BW11 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MXD3Q9BW11 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
MXD3Q9BW11 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
MXD3Q9BW11 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MXD3Q9BW11 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MXD3Q9BW11 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MXD3Q9BW11 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC21.28■■□□□ 1
MXD3Q9BW11 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MXD3Q9BW11 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
MXD3Q9BW11 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MXD3Q9BW11 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MXD3Q9BW11 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
MXD3Q9BW11 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MXD3Q9BW11 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
MXD3Q9BW11 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MXD3Q9BW11 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MXD3Q9BW11 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MXD3Q9BW11 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
MXD3Q9BW11 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC21.27■■□□□ 1
MXD3Q9BW11 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MXD3Q9BW11 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC21.27■■□□□ 1
MXD3Q9BW11 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MXD3Q9BW11 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
MXD3Q9BW11 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
MXD3Q9BW11 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MXD3Q9BW11 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MXD3Q9BW11 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MXD3Q9BW11 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MXD3Q9BW11 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
MXD3Q9BW11 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
MXD3Q9BW11 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MXD3Q9BW11 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
MXD3Q9BW11 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
MXD3Q9BW11 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
MXD3Q9BW11 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
MXD3Q9BW11 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
MXD3Q9BW11 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
MXD3Q9BW11 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MXD3Q9BW11 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
MXD3Q9BW11 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
MXD3Q9BW11 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.3 ms