Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSF4

TIMM29, Mitochondrial import inner membrane translocase subunit Tim29, humanhuman

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMM29Q9BSF4 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TIMM29Q9BSF4 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TIMM29Q9BSF4 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TIMM29Q9BSF4 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TIMM29Q9BSF4 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
TIMM29Q9BSF4 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TIMM29Q9BSF4 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TIMM29Q9BSF4 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TIMM29Q9BSF4 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TIMM29Q9BSF4 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TIMM29Q9BSF4 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TIMM29Q9BSF4 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TIMM29Q9BSF4 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TIMM29Q9BSF4 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TIMM29Q9BSF4 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TIMM29Q9BSF4 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TIMM29Q9BSF4 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TIMM29Q9BSF4 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TIMM29Q9BSF4 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TIMM29Q9BSF4 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TIMM29Q9BSF4 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TIMM29Q9BSF4 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TIMM29Q9BSF4 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TIMM29Q9BSF4 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TIMM29Q9BSF4 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TIMM29Q9BSF4 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TIMM29Q9BSF4 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
TIMM29Q9BSF4 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
TIMM29Q9BSF4 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TIMM29Q9BSF4 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TIMM29Q9BSF4 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TIMM29Q9BSF4 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TIMM29Q9BSF4 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TIMM29Q9BSF4 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TIMM29Q9BSF4 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TIMM29Q9BSF4 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TIMM29Q9BSF4 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TIMM29Q9BSF4 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TIMM29Q9BSF4 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TIMM29Q9BSF4 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TIMM29Q9BSF4 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TIMM29Q9BSF4 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TIMM29Q9BSF4 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TIMM29Q9BSF4 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
TIMM29Q9BSF4 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TIMM29Q9BSF4 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TIMM29Q9BSF4 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TIMM29Q9BSF4 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TIMM29Q9BSF4 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TIMM29Q9BSF4 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TIMM29Q9BSF4 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TIMM29Q9BSF4 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
TIMM29Q9BSF4 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TIMM29Q9BSF4 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TIMM29Q9BSF4 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TIMM29Q9BSF4 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
TIMM29Q9BSF4 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TIMM29Q9BSF4 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
TIMM29Q9BSF4 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TIMM29Q9BSF4 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TIMM29Q9BSF4 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TIMM29Q9BSF4 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TIMM29Q9BSF4 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TIMM29Q9BSF4 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TIMM29Q9BSF4 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TIMM29Q9BSF4 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TIMM29Q9BSF4 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
TIMM29Q9BSF4 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TIMM29Q9BSF4 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
TIMM29Q9BSF4 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TIMM29Q9BSF4 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TIMM29Q9BSF4 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TIMM29Q9BSF4 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TIMM29Q9BSF4 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TIMM29Q9BSF4 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TIMM29Q9BSF4 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TIMM29Q9BSF4 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TIMM29Q9BSF4 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TIMM29Q9BSF4 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TIMM29Q9BSF4 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TIMM29Q9BSF4 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TIMM29Q9BSF4 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TIMM29Q9BSF4 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TIMM29Q9BSF4 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TIMM29Q9BSF4 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TIMM29Q9BSF4 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TIMM29Q9BSF4 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
TIMM29Q9BSF4 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
TIMM29Q9BSF4 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TIMM29Q9BSF4 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TIMM29Q9BSF4 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
TIMM29Q9BSF4 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
TIMM29Q9BSF4 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TIMM29Q9BSF4 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TIMM29Q9BSF4 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TIMM29Q9BSF4 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TIMM29Q9BSF4 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TIMM29Q9BSF4 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TIMM29Q9BSF4 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TIMM29Q9BSF4 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.9 ms