Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRJ9

MESP1, Mesoderm posterior protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 268 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MESP1Q9BRJ9 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
MESP1Q9BRJ9 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MESP1Q9BRJ9 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MESP1Q9BRJ9 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
MESP1Q9BRJ9 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MESP1Q9BRJ9 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
MESP1Q9BRJ9 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MESP1Q9BRJ9 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
MESP1Q9BRJ9 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
MESP1Q9BRJ9 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
MESP1Q9BRJ9 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
MESP1Q9BRJ9 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
MESP1Q9BRJ9 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MESP1Q9BRJ9 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MESP1Q9BRJ9 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
MESP1Q9BRJ9 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MESP1Q9BRJ9 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
MESP1Q9BRJ9 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MESP1Q9BRJ9 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MESP1Q9BRJ9 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MESP1Q9BRJ9 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MESP1Q9BRJ9 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
MESP1Q9BRJ9 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
MESP1Q9BRJ9 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MESP1Q9BRJ9 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
MESP1Q9BRJ9 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MESP1Q9BRJ9 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
MESP1Q9BRJ9 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
MESP1Q9BRJ9 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
MESP1Q9BRJ9 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MESP1Q9BRJ9 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MESP1Q9BRJ9 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MESP1Q9BRJ9 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
MESP1Q9BRJ9 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MESP1Q9BRJ9 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
MESP1Q9BRJ9 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
MESP1Q9BRJ9 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
MESP1Q9BRJ9 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
MESP1Q9BRJ9 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
MESP1Q9BRJ9 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
MESP1Q9BRJ9 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
MESP1Q9BRJ9 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
MESP1Q9BRJ9 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
MESP1Q9BRJ9 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MESP1Q9BRJ9 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MESP1Q9BRJ9 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
MESP1Q9BRJ9 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MESP1Q9BRJ9 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MESP1Q9BRJ9 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
MESP1Q9BRJ9 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MESP1Q9BRJ9 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
MESP1Q9BRJ9 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MESP1Q9BRJ9 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MESP1Q9BRJ9 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
MESP1Q9BRJ9 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MESP1Q9BRJ9 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
MESP1Q9BRJ9 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
MESP1Q9BRJ9 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MESP1Q9BRJ9 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
MESP1Q9BRJ9 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
MESP1Q9BRJ9 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
MESP1Q9BRJ9 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
MESP1Q9BRJ9 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MESP1Q9BRJ9 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MESP1Q9BRJ9 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
MESP1Q9BRJ9 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
MESP1Q9BRJ9 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
MESP1Q9BRJ9 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
MESP1Q9BRJ9 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MESP1Q9BRJ9 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MESP1Q9BRJ9 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
MESP1Q9BRJ9 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MESP1Q9BRJ9 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MESP1Q9BRJ9 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MESP1Q9BRJ9 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
MESP1Q9BRJ9 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
MESP1Q9BRJ9 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MESP1Q9BRJ9 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MESP1Q9BRJ9 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
MESP1Q9BRJ9 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
MESP1Q9BRJ9 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MESP1Q9BRJ9 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
MESP1Q9BRJ9 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MESP1Q9BRJ9 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MESP1Q9BRJ9 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
MESP1Q9BRJ9 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MESP1Q9BRJ9 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
MESP1Q9BRJ9 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
MESP1Q9BRJ9 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
MESP1Q9BRJ9 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
MESP1Q9BRJ9 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
MESP1Q9BRJ9 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
MESP1Q9BRJ9 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
MESP1Q9BRJ9 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
MESP1Q9BRJ9 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
MESP1Q9BRJ9 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
MESP1Q9BRJ9 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
MESP1Q9BRJ9 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
MESP1Q9BRJ9 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
MESP1Q9BRJ9 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.1 ms