Protein–RNA interactions for Protein: Q99941

ATF6B, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-6 beta, humanhuman

Predictions only

Length 703 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATF6BQ99941 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ATF6BQ99941 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATF6BQ99941 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATF6BQ99941 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATF6BQ99941 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATF6BQ99941 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATF6BQ99941 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATF6BQ99941 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATF6BQ99941 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATF6BQ99941 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATF6BQ99941 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATF6BQ99941 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATF6BQ99941 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATF6BQ99941 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATF6BQ99941 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATF6BQ99941 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATF6BQ99941 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATF6BQ99941 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ATF6BQ99941 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATF6BQ99941 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATF6BQ99941 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ATF6BQ99941 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATF6BQ99941 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATF6BQ99941 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATF6BQ99941 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATF6BQ99941 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATF6BQ99941 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ATF6BQ99941 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATF6BQ99941 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATF6BQ99941 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATF6BQ99941 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATF6BQ99941 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATF6BQ99941 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATF6BQ99941 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ATF6BQ99941 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATF6BQ99941 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATF6BQ99941 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATF6BQ99941 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATF6BQ99941 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATF6BQ99941 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATF6BQ99941 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATF6BQ99941 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATF6BQ99941 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ATF6BQ99941 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATF6BQ99941 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATF6BQ99941 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATF6BQ99941 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATF6BQ99941 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATF6BQ99941 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATF6BQ99941 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATF6BQ99941 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATF6BQ99941 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATF6BQ99941 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATF6BQ99941 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATF6BQ99941 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATF6BQ99941 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATF6BQ99941 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATF6BQ99941 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATF6BQ99941 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATF6BQ99941 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATF6BQ99941 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATF6BQ99941 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
ATF6BQ99941 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATF6BQ99941 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATF6BQ99941 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATF6BQ99941 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATF6BQ99941 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATF6BQ99941 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATF6BQ99941 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATF6BQ99941 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
ATF6BQ99941 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATF6BQ99941 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATF6BQ99941 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATF6BQ99941 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATF6BQ99941 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATF6BQ99941 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATF6BQ99941 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATF6BQ99941 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATF6BQ99941 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATF6BQ99941 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATF6BQ99941 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATF6BQ99941 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATF6BQ99941 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATF6BQ99941 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATF6BQ99941 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATF6BQ99941 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATF6BQ99941 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATF6BQ99941 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATF6BQ99941 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATF6BQ99941 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATF6BQ99941 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATF6BQ99941 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATF6BQ99941 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATF6BQ99941 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATF6BQ99941 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATF6BQ99941 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATF6BQ99941 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATF6BQ99941 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
ATF6BQ99941 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATF6BQ99941 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms